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gATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCTCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCCAGAGTTGATCAGCCAGGCGATGAAATTCACTGTCGTTCATTGTTGTATCCTGTTTTTAAGTGATGGCGGCAGTATAGCGGCATGGGGTCAGGGCTTCAAAGTTTGCACCTCTGCGGCTGCGTTCCGGCACGATTCATCCGTCACCGGAATAATGATGTCTCTGTGTAGCGAAAGATTTGTCTCTTCATTAGGGCGCAGTTACACCACGTCTTTCCCTGTTTCTGGTAAACATTATGAt < 1:11653/300‑1 (MQ=255) cGATATCGCTGTCGTCATCTCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCCAGAGTTGATCAGCCAGGCGATGAAAGTCACTGTCGTTCATTGTTGTATCCTGTTTTTAAGTGATGGCGGCAGTATAGCGGCATGGGGTCAGGGCTTCAAAGTTTGCACCTCTGCGGCTGCGTTCCGGCACGATTCATCCGTCACCGGAATAATGATGTCTCTGTGTAGCGAAAGATTTGTCTCTTCATTAGGGCGCAGTTACACCACGTCTTTCCCTGTTTCTGGTAAACATTATGATCAGGTTTACcg < 2:182290/300‑1 (MQ=255) cGATATCGCTGTCGCCATCTCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCCAGAGTTGATCAGCCAGGCGATGAAATTCACTGTCGTTCATTGTTGTATCCTGTTTTTAAGTGATGGCGGCAGTAGAGCGGCATGGGGTCAGGGCTTCAAAGTTTGCACCTCTGCGGCTGCGTTCCGGCACGATTCATCCGTCACCGGAATAATGATGTCTCTGTGTAGCGAAAGATTTGTCTCTTCATTAGGGCGCAGTTACACCACGTCTTTCCCTGTTTCTGGTAAACATTATGATCAGGTTTACcg < 2:189849/300‑1 (MQ=255) atatCGCTGTCGCCATCTCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCCAGAGTTGATCAGCCAGGCGATGAAATTCACTGTCGTTCATTGTTGTATCCTGTTTTTAAGTGATGGCGGCAGTATAGCGGCATGGGGTCAGGGCTTCAAAGTTTGCACCTCTGCGGCTGCGTTCCGGCACGATTCATCCGTCACCGGAATAATGATGTATATGTGTAGCGAAAGATTTGTCTATTCATTAGGGCGCAGTTACACCACGTCTTTCCCTGTTTCTGGTACACATTATGATCAGGTTTACcgag > 1:122988/1‑300 (MQ=255) gTCGCCATCTCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCCAGAGTTGATCAGCCAGGCGATGAAATTCACTGTCGTTCATTGTTGTATCCTGTTTTTAAGTGATGGCGGCAGTATAGCGGCATGGGGTCAGGGCTTCAAAGTTTGCACCTCTGCGGCTGCGTTCCGGCACGATTCATCCGTCACCGGAATAATGATGTCTATGTGTAGCGAAAGATTTGTCTATTCATTAGGGCGCAGTTACACCACGTCTTTCCCTGTTTCTGGTAAACATTATGATCAGGTTTACCGAGCGAGCATc > 1:28762/1‑300 (MQ=255) cGCCATCTCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCCAGAGTTGATCAGCCATGCGATGAAATTCACTGTCGTTCATTGTTGTATCCTGTTTTTAAGTGATGGCGGCAGTATAGCGGCATGGGGTCAGGGCTTCAAAGTTTGCACCTCTGCGGCTGCGTTCCGGCACGATTCATCCGTCACCGGAATAATGATGTCTCTGTGTAGCGAAAGATTTGTCTCTTCATTAGGGCGCAGTTACACCACGTCTTTCCCTGTTTCTGGTAAACATTATGATCAGGTTTACCGAGCGAGCATCCt < 1:668857/300‑1 (MQ=255) | CGTGATGAACGTGCCGGAAAGCGAGGCTTATCCGGCATGCAATCTTAGCGGAAACTGACTGTTTCACCCGCCTGCTGCGTCGCCGCCTGTTCCAGCAAATCCCAGAAGGTTTCGCCGCTGCGATCACAAATCCACTCATCGCCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTCAGCCAGAGTTGATCAGCCAGGCGATGAAATTCACTGTCGTTCATTGTTGTATCCTGTTTTTAAGTGATGGCGGCAGTATAGCGGCATGGGGTCAGGGCTTCAAAGTTTGCACCTCTGCGGCTGCGTTCCGGCACGATTCATCCGTCACCGGAATAATGATGTCTCTGTGTAGCGAAAGATTTGTCTCTTCATTAGGGCGCAGTTACACCACGTCTTTCCCTGTTTCTGGTAAACATTATGATCAGGTTTACCGAGCGAGCATCCT > NC_000913/3993695‑3994280 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |