| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 275,668 | G→A | G115E (GGA→GAA) | mmuP → | S‑methyl‑L‑methionine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 275,668 | 0 | G | A | 98.2% | 194.3 / ‑5.8 | 57 | G115E (GGA→GAA) | mmuP | S‑methyl‑L‑methionine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (32/24); total (32/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCACGGTGGCTTACCGATTTT > NC_000913/275373‑275944 | cgTCACCTGATTATGCTTTCCTTGTGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTc < 1:177333/300‑1 (MQ=255) tGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGc < 1:173947/300‑1 (MQ=255) tGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCATGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGTGTACATTATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGGGCGCTGGTGGGCGGGCTGGTGATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTAGGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACTGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTATTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGc < 2:299586/300‑1 (MQ=255) gtGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTAc < 2:65097/299‑1 (MQ=255) aTGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCTGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTAc < 2:598947/300‑1 (MQ=255) aTGCTTTCCTGGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTAc < 2:407249/300‑1 (MQ=255) tGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTAcc > 1:65251/1‑299 (MQ=255) ggATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTgg > 1:489010/1‑300 (MQ=255) ttattCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGc > 2:322717/1‑300 (MQ=255) attCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTNGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTNCCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCgt < 2:524556/300‑1 (MQ=255) aaTACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTc < 1:179360/300‑1 (MQ=255) aaTACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTAGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGNCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTc < 1:438296/300‑1 (MQ=255) tACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGGGATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACAGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTg < 1:343786/300‑1 (MQ=255) cGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTgcgc < 1:194399/300‑1 (MQ=255) cGGGTACATCATTTCCACCACGGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTgcgc < 2:505734/300‑1 (MQ=255) agttacaccacTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGTTGGTCTGGCGGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGTGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGTTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTAttttt < 2:229809/295‑1 (MQ=255) ctgctgGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTTGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCttt > 1:563140/1‑300 (MQ=255) ctgctgGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGAACGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCttt > 2:49045/1‑300 (MQ=255) ggCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGNGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCAGGCGCTNTTTTGc > 2:543216/1‑300 (MQ=255) tATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGaa > 1:613150/1‑300 (MQ=255) tCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAgg > 1:117368/1‑300 (MQ=255) gttgttggtCGGGCTGGTTAGGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGTTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGTTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGtt < 1:5380/295‑1 (MQ=255) gcTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGTTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGtt < 2:598070/300‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTtc > 1:530031/1‑300 (MQ=255) gtCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTg > 1:555444/1‑300 (MQ=255) ggTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGTTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGt < 2:402750/300‑1 (MQ=255) gTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTNGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTANCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTg > 2:429623/1‑300 (MQ=255) gTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTg > 1:388843/1‑300 (MQ=255) gTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTC‑ACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTgg > 2:15271/1‑300 (MQ=255) gtgtCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTat < 1:317202/300‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCg < 1:221520/300‑1 (MQ=255) gcgATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGNTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGt < 1:454529/300‑1 (MQ=255) gaCCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGAt > 1:571603/1‑300 (MQ=255) gCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGc < 1:299899/300‑1 (MQ=255) gTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGTGATTTTCGGCtt > 2:283923/1‑300 (MQ=255) cGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTcc > 2:358626/1‑300 (MQ=255) cGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACAGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCTTCGGTGGGGCGGCGGTTTTCGGATTTATTcc > 2:347003/1‑300 (MQ=255) tttATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTAGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTcaga > 2:186275/1‑297 (MQ=255) gcgcgcTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGAt < 1:575821/300‑1 (MQ=255) gcgcTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATgg > 2:283850/1‑300 (MQ=255) cTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTc < 1:352579/300‑1 (MQ=255) aTCTTGGTCCGGCTCCCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGCCCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTACACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGc > 1:269696/1‑300 (MQ=255) aTCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGGTTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTAGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGc > 2:60836/1‑300 (MQ=255) cGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCgg > 1:203081/1‑300 (MQ=255) cGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGTGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGGTGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAg > 2:315297/1‑300 (MQ=255) ggTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTa > 1:14105/1‑300 (MQ=255) gTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTaa < 1:489505/300‑1 (MQ=255) gTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCNGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGNTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCAGAGTaa > 2:460058/1‑300 (MQ=255) aCCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATc > 2:652863/1‑300 (MQ=255) ggCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTCTTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTAGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGc > 2:374562/1‑300 (MQ=255) cTTTACNGGCTGACCTGGACCGTGGCGCGGGGTTCGAGCTTTACCGCTGC‑GGAGNTCTGTATGCGGTATTTGTTTCTACAGGTGCTGGTGTGGGTCTGGTGTGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGTTCTGAGTTTTATCTCCACGCCCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGc < 2:553659/300‑1 (MQ=255) gACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTNCCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATNTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTAGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCa > 2:473846/1‑300 (MQ=255) gACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCa > 1:306180/1‑300 (MQ=255) gACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTAGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGAAGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTTCCGCa > 2:349461/1‑300 (MQ=255) aCCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCAGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCAc > 1:41038/1‑300 (MQ=255) cTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCACgg < 1:520878/300‑1 (MQ=255) gggTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCACGGTGGCTTACCGAtttt > 1:179263/1‑300 (MQ=255) | CGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGA‑TTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCACGGTGGCTTACCGATTTT > NC_000913/275373‑275944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |