| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,542,448 | IS5 (–) +4 bp | coding (412‑415/597 nt) | fimE → | regulator for fimA |
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ATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGGACCTTGACCTTAATGAAGGTAGAATAAATATTCGCCGACTGAAGAACGGATTTTCTACCGTTCACCCGTTACGTTTTGATGAGCGTGAAGCCGTGGAACGCTGGACCCAGGAACGTGCTAACTGGAAAGGCGCTGACCGGACTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAA > NC_000913/4542149‑4542746 | ggATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCCGGACCTTGACCTTAATGAAGGTAGAATAAATATTCGCCGACTGAAGAACGGATTTTCTACCGTTCACCCGTTACGTTTTGATGAGCGTGAAGCCGTGGAACGCTGGACCCAGGAACGTGCTAACTGGAAAGGCGCTGACCGGACTGACGCTATATTTATTTCTCGCAGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCACACGTTaa > 2:211921/1‑300 (MQ=255) 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cTCATCCTCATATGTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttg < 2:119068‑M2/300‑283 (MQ=255) cATCTGTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagtcgattttttctaccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttacggcgttatccccagtttttagtgcgatctctaccactgacgtatcatttggtccgcacgaaacaggttggccagcgtgactaacatcgccagttggttatcttttttcagcaaccacttgtatctggctttcacgaagacgaattgtcgcttgatgatgcg < 2:346886‑M2/300‑291 (MQ=255) cATATGTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtntcttcgccatttaaggcgttatccccngtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttgatgatgcg < 2:447717‑M2/300‑291 (MQ=255) tccTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGTGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGACATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGACAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTGCGTATTTTTTCTAAAGCATAAAGATATTa > 2:135361‑M2/4‑300 (MQ=255) tccTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAGACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCNAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTa > 2:482227‑M2/4‑300 (MQ=255) tccTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTCTTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTa > 1:158917‑M2/4‑300 (MQ=255) 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ATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGGACCTTGACCTTAATGAAGGTAGAATAAATATTCGCCGACTGAAGAACGGATTTTCTACCGTTCACCCGTTACGTTTTGATGAGCGTGAAGCCGTGGAACGCTGGACCCAGGAACGTGCTAACTGGAAAGGCGCTGACCGGACTGACGCTATATTTATTTCTCGCCGCGGGAGTCGGCTTTCTCGCCAGCAGGCCTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAA > NC_000913/4542149‑4542746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |