Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,088,010 | 2 bp→TT | intergenic (+150/‑273) | metK → / → galP | methionine adenosyltransferase/galactose:H(+) symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,088,010 | 0 | C | T | 99.2% | 430.6 / NA | 127 | intergenic (+150/‑274) | metK/galP | methionine adenosyltransferase/galactose:H(+) symporter |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,088,011 | 0 | C | T | 99.2% | 446.2 / NA | 127 | intergenic (+151/‑273) | metK/galP | methionine adenosyltransferase/galactose:H(+) symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (63/63); total (63/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CATACGGTCTGATTCAGATGCTGGATCTGCTGCACCCGATCTACAAAGAAACCGCAGCATACGGTCACTTTGGTCGTGAACATTTCCCGTGGGAAAAAACCGACAAAGCGCAGCTGCTGCGCGATGCTGCCGGTCTGAAGTAATCTTTCTTCACCTGCGTTCAAAGGCCAGCCTCGCGCTGGCCTTTTTCTTTTGGATAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATCACAACTGAAACCGATTACACCAACCACAACAGACAAAGATTTGTAATATTTTCATATTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAA > NC_000913/3087718‑3088297 || cATACGGTCTGATTCAGATGCTGGATCTGCTGCACCCGATCTACAAAGAAACCGCAGCATACGGTCACTTTGGTCGTGAACATTTCCCGTGGGAAAAAACCGACAAAGCGCAGCTGCTGCGCGATGCTGCCGGTCTGAAGTAATCTTTCTTGACCTGCGTTCAAAGGCCAGCCTCGCGCTGGCCTTTTTCTTTTNGATAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTGCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATCACAACTGAAATTGATTac > 2:659806/1‑300 (MQ=255) 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CATACGGTCTGATTCAGATGCTGGATCTGCTGCACCCGATCTACAAAGAAACCGCAGCATACGGTCACTTTGGTCGTGAACATTTCCCGTGGGAAAAAACCGACAAAGCGCAGCTGCTGCGCGATGCTGCCGGTCTGAAGTAATCTTTCTTCACCTGCGTTCAAAGGCCAGCCTCGCGCTGGCCTTTTTCTTTTGGATAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATCACAACTGAAACCGATTACACCAACCACAACAGACAAAGATTTGTAATATTTTCATATTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAA > NC_000913/3087718‑3088297 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |