| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 384,839 | G→A | intergenic (‑223/‑393) | yaiS ← / → tauA | putative deacetylase YaiS/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 384,839 | 0 | G | A | 99.4% | 560.7 / NA | 153 | intergenic (‑223/‑393) | yaiS/tauA | putative deacetylase YaiS/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (78/74); minor base C (1/0); total (79/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TGCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCT > NC_000913/384545‑385134 | tgCGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTATAttt < 1:122897/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |