Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,575,254 | 0 | G | A | 99.1% | 391.2 / NA | 111 | intergenic (+1323/+1658) | yjiT/mcrC | putative uncharacterized protein YjiT/Type IV methyl‑directed restriction enzyme EcoKMcrBC subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (59/51); minor base C (1/0); total (60/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CTGCAACCGGTGGGAAAGCCGCGACTATCCTGGTATCCCGAACCTGGACGGAGATGGTTAACGAGCTTAAAGAGAGAGCCGATATCCGCGGGCCGGTTCTGCAATATAACCATTATCTTAAGCCTGAAGTGTTTAATGAAAACGGCGGCCCCCTTAAGCTTTCTGAAATGTTGTTGTTCCGGGAATTCATGCGTCGCCCTAAACGGACTAACAGCCTGGAAACACAGGGGCTGGTTCAGGTTGGTTACCAGGGGCTGGAGAAAATACATAAGAGCCCCTTGCACTGGCAGGAAAAAGGATTAACGCTGGATGACTGGCGCGATTTTCTCAAGGTTACGTTGGATCATTACGTTCGCGAGAGCAACTTCACACAGCTGGATGATGAGCTGAAAAACTGGATTGGTAGCCGTTTTTCATCAAAATTCGTCCGTAACCCGGAATCAAAAGATCCTGAAGATAATCAGAACAGACGCTGGCCTCAAATTCGTAATGGCAACGTATCCCATCGTTTAGCGAAGTTGCTGATGCTGGGGGCTGGATTCAAAACCGTCAATGCGGCAACTATTGATATTATCAATACATGGCTGAAAGA > NC_000913/4574958‑4575549 | cTGCAACCGGTGGGAAAGCCGCGACTATCCTGGTATCCCGAACCTGGACGGAGATGGTTAACGAGCTTAAAGAGAGAGCCGATATCCGCGGGCCGGTTCTGCAATATAACCATTATCTTAAGCCTGAAGTGTTTAATGAAAACGGCGGCCCCCTTAAGCTTTCTGAAATGTTGTTGTTCCGGGAATTCATGCGTCGCCCTAAACGGACTAACAGCCTGGAAACACAGGGGCTGGTTCAGGTTGGTTACCAGGGGCTGGAAAAAATACATAAGAGCCCATTGCACTGGCAGGAAAAAAGAt > 2:396976/1‑300 (MQ=255) 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aaaaAGATTAACGCTGGATGACTGGCGCGATTTTCTCAATGTTACGTTGGATCATTACGTTCTCGAGAGCAACTTCACACAGCTGGATGATGAGCTGAAAAACTGGATTGGTAGCCGTTTTTCATCAAAATTCGTCCGTAACCCGGAATCAAAAGATCCTGAAGATAATCAGAACAGACGCTGGCCTCAAATTCGTAATGGCAACGTATCCCATCGTTTAGCGAAGTTGCTGATGCTGGGGGCTGGATTCAAAACCGTCAATGCGGCAACTATTGATATTATCAATACATGGCTGAaaga < 2:743547/300‑1 (MQ=255) aaaaAGATTAACGCTGGATGACTGGCGCGATTTTCTCAAGGTTACGTTGGATCATTACGTTCGCGAGAGCAACTTCACACAGCTGGATGATGAGCTGAAAAACTGGATTGGTAGCCGTTTTTCATCAAAATTCGTCCGTAACCCGGAATCAAAAGATCCTGAAGATAATCAGAACAGACGCTGGCCTCAAATTCGTAATGGCAACGTATCCCATCGTTTAGCGAAGTTGCTGATGCTGGGGGCTGGATTCAAAACCGTCAATGCGGCAACTATTGATATTATCAATACATGGCTGAaaga < 1:484806/300‑1 (MQ=255) aaaaAGATTAACGCTGGATGACTGGCGCGATTTTCTCAAGGTTACGTTGGATCATTACGTTCGCGAGAGCAACTTCACACAGCTGGATGATGAGCTGAAAAACTGGATTGGTAGCCGTTTTTCATCAAAATTCGTCCGTAACCCGGAATCAAAAGATCCTGAAGATAATCAGAACAGACGCTGGCCTCAAATTCGTAATGGCAACGTATCCCATCGTTTAGCGAAGTTGCTGATGCTGGGGGCTGGATTCAAAACCGTCAATGCGGCAACTATTGATATTATCAATACATGGCTGAaaga < 2:408600/300‑1 (MQ=255) | CTGCAACCGGTGGGAAAGCCGCGACTATCCTGGTATCCCGAACCTGGACGGAGATGGTTAACGAGCTTAAAGAGAGAGCCGATATCCGCGGGCCGGTTCTGCAATATAACCATTATCTTAAGCCTGAAGTGTTTAATGAAAACGGCGGCCCCCTTAAGCTTTCTGAAATGTTGTTGTTCCGGGAATTCATGCGTCGCCCTAAACGGACTAACAGCCTGGAAACACAGGGGCTGGTTCAGGTTGGTTACCAGGGGCTGGAGAAAATACATAAGAGCCCCTTGCACTGGCAGGAAAAAGGATTAACGCTGGATGACTGGCGCGATTTTCTCAAGGTTACGTTGGATCATTACGTTCGCGAGAGCAACTTCACACAGCTGGATGATGAGCTGAAAAACTGGATTGGTAGCCGTTTTTCATCAAAATTCGTCCGTAACCCGGAATCAAAAGATCCTGAAGATAATCAGAACAGACGCTGGCCTCAAATTCGTAATGGCAACGTATCCCATCGTTTAGCGAAGTTGCTGATGCTGGGGGCTGGATTCAAAACCGTCAATGCGGCAACTATTGATATTATCAATACATGGCTGAAAGA > NC_000913/4574958‑4575549 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |