Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,427,977 | 0 | G | A | 99.2% | 478.8 / NA | 135 | intergenic (‑555/+102) | yjfZ/ytfB | DUF2686 domain‑containing protein YjfZ/cell division protein YtfB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (51/82); total (52/83) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GCAGGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTATTATATTGCTAATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATCAAAGTAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTATCAATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCCTTCTACCTGCGCCATTGCATAGACATCGGTAGCGG > NC_000913/4427681‑4428272 | gcagGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTATTATATTGCTAATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATCAAAGTAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGACCt < 2:647856/300‑1 (MQ=255) 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aCGCTTGACCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTATCAATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCCTTCTACCTGCGCCATTGCATAGACATCGGTAg < 2:229550/300‑1 (MQ=255) aCGCTTGACCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTATCAATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCCTTCTACCTGCGCCATTGCATAGACATCGGTAg < 1:328119/300‑1 (MQ=255) aCGCTTGACCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGGAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTATCAATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCCTTCTACCTGCGCCATTGCATAGACATCGGTAg < 2:22495/300‑1 (MQ=255) cGCTTGACCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTCTCAATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCATTCTACCTGCGCCATTGCATAGACCCCGGTAGc > 1:285993/1‑300 (MQ=255) cGCTTGACCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTATCAATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCCTTCTACCTGCGCCATTGCATAGACATCGGTAGc > 1:488525/1‑300 (MQ=255) cTTGACCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTATCNATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCCTTCNACCTGCGCCATTGCATAGACATCGGTAGCgg < 2:542535/300‑1 (MQ=255) | GCAGGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTATTATATTGCTAATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATCAAAGTAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACCATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAACAGGACCTGTTGATTATTCCCCGTATCAATGGTTAAGCCCGTCACCACGCCGCTGGCGTTCTGGCGGATTTTCACCATCTGCCCGTTTTGCAAATTACTCAGCGGCTTACCCGCGCCTTCTACCTGCGCCATTGCATAGACATCGGTAGCGG > NC_000913/4427681‑4428272 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |