| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,092,703 | A→G | F41L (TTC→CTC) | frvA ← | putative PTS enzyme IIA component FrvA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,092,703 | 0 | A | G | 99.0% | 376.0 / NA | 104 | F41L (TTC→CTC) | frvA | putative PTS enzyme IIA component FrvA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (53/50); total (54/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
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agGGTTTGCAGGAGCTGGTGTGAGTCGGTGATAAAACCGTTTTGTAACGCTATTGTCGCCAACTGCTTCAGAACGGAATAAGCGCCATTGCCCTGAATATTCAGGTCAATACAGCTTGCAGTAAGAGCTGCCATTAATCGGACTCCATAAAATATATTTTAATCAATTGTAATGGTGGAGCGATTAAGTGATGAGAGGCGATATGTCGGTAAACAATGACAATTTGAGACAGAGTGAAAGGTCAGATTTGCGGAGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAAt < 1:754219/300‑1 (MQ=255) gTTTGCAGGAGCTGGTGTGAGTCGTTGATAAAACCGTTTTTTAACGCTATTGTCGCCAACTGCTTCAGAACGGAATAAGCGCCATTGCCCTGAATATTCAGTTCAATACAGCTTGCAGTAAGAGCTGCCATTAATCGGACTCCATAAAATATATTTTAATCAATTGTAATGGTGGAGCGAGTAAGTGATGAGAGGCGATATGTCGGTAAACAATGACAATTTGAGACAGAGTGAAAGGTCAGATTTGCGGAGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATggg < 2:868/300‑1 (MQ=255) gTTTGCAGGAGCTGGTGTGAGTCGGTGATAAAACCGTTTTGTAACGCTATTGTCGCCAACTGCTTCAGAACGGAATAAGCGCCATTGCCCTGAATATTCAGGTCAATACAGCTTGCAGTAAGAGCTGCCATTAATCGGACTCCATAAAATATATTTTAATCAATTGTAATGGTGGAGCGATTAAGTGATGAGAGGCGATATGTCGGTAAACAATGACAATTTGAGACAGAGTGAAAGGTCAGATTTGCGGAGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATggg < 1:174687/300‑1 (MQ=255) | AGCACCTGGTCGGTATCGCCCTGTTGCAGTTGATGAATAAATTCCTTGTGAATAATTTTGCGACACAGTGTGCCGATGATTTTGACCTGATCCTCTTCGCCGCTTTGCGGCACGCCGAGGCAGATCCAGCAATTGACGTCTTCGCCATCGCTGGCTTTCCAGTCAATAGCCTGCGCTTTGCGGGCGAATAATACGAACGGTTGTTTAACGCAGGCGCTTTTACCGTGCGGCACGGCGACACCGGAACCAAATCCAGTAGAGTGCATTTTTTCGCGCAGCAGCAGGGTTTGCAGGAACTGGTGTGAGTCGGTGATAAAACCGTTTTGTAACGCTATTGTCGCCAACTGCTTCAGAACGGAATAAGCGCCATTGCCCTGAATATTCAGGTCAATACAGCTTGCAGTAAGAGCTGCCATTAATCGGACTCCATAAAATATATTTTAATCAATTGTAATGGTGGAGCGATTAAGTGATGAGAGGCGATATGTCGGTAAACAATGACAATTTGAGACAGAGTGAAAGGTCAGATTTGCGGAGTAATGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGG > NC_000913/4092408‑4092992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |