| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,078,842 | G→A | intergenic (+404/‑449) | fabY → / → yiiE | putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,078,842 | 0 | G | A | 99.4% | 621.9 / NA | 172 | intergenic (+404/‑449) | fabY/yiiE | putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (81/90); minor base C (1/0); total (82/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
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ctTAAACCGTGGGAAGGAAGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGAt > 1:620896/1‑300 (MQ=255) ctTAAACCGTGGGAAGGAAGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAANCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGAt > 1:514967/1‑300 (MQ=255) gTGGGAAGGAAGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAAc > 1:658970/1‑300 (MQ=255) | CTCCATACGTGTCTTGCTACATCACTGTTCAGGAGCATTTAAATATTATTTGTAGAACTGAGTGGCAATTATCGCAGATAATGCTTAATTCATCATCTTAGTTCATGTTTGAGCGATTTTTGATAGTCAAAACCCCCTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAAC > NC_000913/4078547‑4079131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |