| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,861,443 | C→T | S5F (TCT→TTT) | ygbJ → | putative L‑threonate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,861,443 | 0 | C | T | 99.0% | 325.3 / NA | 95 | S5F (TCT→TTT) | ygbJ | putative L‑threonate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (36/58); minor base G (1/0); total (37/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGTTAGTTCAGCAATACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGGCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCATGTCGGTATCGTTGGCTTAGGGTCAATGGGAATGGGAGCAGCACTGTCATATGTCCGCGCAGGTCTTTCTACCTGGGGCGCAGACCTGAACAGCAATGCCTGCGCTACGTTGAAAGAGGCAGGTGCTTGCGGGGTTTCTGATAACGCCGCGACGTTTGCCGAAAAACTGGACGCACTGCTGGTGCTGGTGGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATC > NC_000913/2861156‑2861738 | ccGTTAGTTCAGCAATACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGGCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATTTGAGTTTCATGt < 2:377491/300‑1 (MQ=255) tAGTTCAGCAATACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGGCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATTTGAGTTTCATGTCGGt < 1:55456/300‑1 (MQ=255) tCAGCAATACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGGCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATTTGAGTTTCATGTCGGTATCg < 1:434666/300‑1 (MQ=255) aTACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGTCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATTTGAGTTTCATGTCGGTATCGTTGGCt < 1:605094/300‑1 (MQ=255) 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