| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,797,777 | C→T | I86I (ATC→ATT) | ygaP → | thiosulfate sulfurtransferase YgaP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,797,777 | 0 | C | T | 99.1% | 398.3 / NA | 111 | I86I (ATC→ATT) | ygaP | thiosulfate sulfurtransferase YgaP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (49/61); minor base G (0/1); total (49/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ATGTCTATTGTCCGTAAGGAGTCACTATGGCTTTGACAACCATTTCGCCGCATGATGCACAAGAATTAATCGCACGCGGCGCAAAGTTAATCGATATTCGTGATGCTGATGAATATCTTCGTGAACATATTCCTGAAGCAGATCTGGCTCCATTATCCGTGCTGGAACAGTCAGGTCTTCCGGCTAAATTACGTCACGAGCAAATTATATTCCACTGCCAGGCAGGTAAACGCACCAGTAATAATGCCGATAAATTAGCAGCGATTGCCGCCCCCGCAGAAATCTTTTTACTCGAAGATGGGATTGATGGCTGGAAAAAAGCAGGATTGCCAGTAGCGGTAAATAAATCTCAACCCTTGCCGTTAATGCGCCAGGTGCAGATCGCTGCGGGTGGTTTAATATTAATCGGCGTTGTACTGGGTTATACCGTAAATAGCGGTTTCTTCTTATTAAGTGGCTTTGTTGGTGCCGGGTTACTGTTTGCAGGAATCAGCGGTTTTTGTGGAATGGCAAGGTTGTTAGATAAGATGCCGTGGAACCAACGAGCTTGAGAAGCGACGCCGGACGCGCCCTAGCAG > NC_000913/2797494‑2798071 | aTGTCTATTGTCCGTAAGGAGTCACTATGGCTTTGACAACCATTTCGCCGCATGATGCACAAGAATTAATCGCACGCGGCGCAAAGTTAATCGATATTCGTGATGCTGATGAATATCTTAGTGAACATATTCCTGAAGCAGATCTGGCTCCATTATCCGTGCTGGAACAGTCAGGTCTTCCGGCTAAATTACGTNACGAGCAAATTATATTCCACTGCCAGGCAGGTAAACGCACCAGTAATAATGCCGATAAATTAGCAGCGATTGCCGCCCCCGCAGAAATTTTTTTACTCGAAGATg > 2:670410/1‑300 (MQ=255) 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ATGTCTATTGTCCGTAAGGAGTCACTATGGCTTTGACAACCATTTCGCCGCATGATGCACAAGAATTAATCGCACGCGGCGCAAAGTTAATCGATATTCGTGATGCTGATGAATATCTTCGTGAACATATTCCTGAAGCAGATCTGGCTCCATTATCCGTGCTGGAACAGTCAGGTCTTCCGGCTAAATTACGTCACGAGCAAATTATATTCCACTGCCAGGCAGGTAAACGCACCAGTAATAATGCCGATAAATTAGCAGCGATTGCCGCCCCCGCAGAAATCTTTTTACTCGAAGATGGGATTGATGGCTGGAAAAAAGCAGGATTGCCAGTAGCGGTAAATAAATCTCAACCCTTGCCGTTAATGCGCCAGGTGCAGATCGCTGCGGGTGGTTTAATATTAATCGGCGTTGTACTGGGTTATACCGTAAATAGCGGTTTCTTCTTATTAAGTGGCTTTGTTGGTGCCGGGTTACTGTTTGCAGGAATCAGCGGTTTTTGTGGAATGGCAAGGTTGTTAGATAAGATGCCGTGGAACCAACGAGCTTGAGAAGCGACGCCGGACGCGCCCTAGCAG > NC_000913/2797494‑2798071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |