Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 314,622 | 0 | G | A | 99.1% | 410.2 / NA | 114 | intergenic (‑1380/‑669) | ykgR/insE1 | putative membrane protein YkgR/IS3 element protein InsE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (59/54); minor base C (1/0); total (60/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
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cAGTCAGCCAGATAACGAGGCGACACGTAACTTTATTACCCGAATGGCCACAGCTAAAGCTAACCAGGAAATACAGGAGTGGCTCGGGAAATATGGTACTGCGCGCGTCAAACTGAATGTCGATAAAGATTTCTCGCTGAAGGATTCTTCGCTGGAAATGCTTTATCCGATTTATGATACGCCGACAAATATGTTGTTCACTCAGGGGGCAATACATCGTACAGACGATCGTACTCAGTCAAATATTGGTTTTGGCTGGCGTCATTTTTCAGGAAATGACTGGATGGCGGGGGTGAATAc < 2:655302/300‑1 (MQ=255) aGATAACGATGCGACCCGTAAATTTATTAACGGAACGGCCACAGCTAAAGCTAACCAGGAAATACAGGAGTGACTCGGGAAATATGGTACTGCGCGCGTCAAACTGAATGTCGATAAAGATTTCTCGCTGAAAGATTCTTCGCTGGAAATGCTTTATCCGATTTATGATACGTCGACAAATATGTTGTTCACTCAAGGGGCAATACATCGTACAGACGATCGTACTCAGTCAAATATTGGTTTTGGCTGGCGTCATTTTTCAGGAAATAACTGGATGGCGGGGGTGAATACGTTTAttga > 2:240230/1‑297 (MQ=255) gATAACGATGCGACACGTAACTTTATTACCGGAATGGCCACAGCTAAAGCTAACCAGGAAATACAGGAGTGGCTCGGGAAATATGGTACTGCGCGCGTCAAACTGAATGTCGATAAAGATTTCTCGCTGAAGGATTCTTCGCTGGAAATGCTTTATCCGATTTATGATACGCCGACAAATATGTTGTTCACTCAGGGGGCAATACATCGTACAGACGATCGTACTCAGTCAAATATTGGTTTTGGCTGGCGTCATTTTTCAGGAAATGACTGGATGGCGGGGGTGAATACTTTTATCGAt > 1:660192/1‑300 (MQ=255) | TCGTTAATTCGTTCATCAGGAAATTATCTCAATGTCACATTATAAAACAGGTCATAAACAACCACGATTTCGTTATTCAGTTCTGGCCCGCTGCGTGGCGTGGGCAAATATCTCTGTTCAGGTTCTTTTTCCACTCGCTGTCACCTTTACCCCAGTAATGGCGGCACGTGCGCAGCATGCGGTTCAGCCACGGTTGAGCATGGGAAATACTACGGTAACTGCTGATAATAACGTGGAGAAAAATGTCGCGTCGTTTGCCGCAAATGCCGGGACATTTTTAAGCAGTCAGCCAGATAGCGATGCGACACGTAACTTTATTACCGGAATGGCCACAGCTAAAGCTAACCAGGAAATACAGGAGTGGCTCGGGAAATATGGTACTGCGCGCGTCAAACTGAATGTCGATAAAGATTTCTCGCTGAAGGATTCTTCGCTGGAAATGCTTTATCCGATTTATGATACGCCGACAAATATGTTGTTCACTCAGGGGGCAATACATCGTACAGACGATCGTACTCAGTCAAATATTGGTTTTGGCTGGCGTCATTTTTCAGGAAATGACTGGATGGCGGGGGTGAATACTTTTATCGAT > NC_000913/314326‑314917 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |