| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,291,519 | G→A | R21R (AGG→AGA) | galU → | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,291,519 | 0 | G | A | 99.0% | 362.8 / NA | 102 | R21R (AGG→AGA) | galU | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (55/46); total (55/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GGTCGACTGCGCTTGATGTTGTCTGCAGAATGAGCAAACGATAACGCGGGCTAAATTTGCATTACCTGCTAATGTCGGCTGGTGGTACTATCGTCGCCATTCGTATAAGTAATTGTCTTAATTATGCTAACTCGCCTCCTTTTCAGAACTTAGCCCCTTCGGGGTGCTGATATACTGGGATGCGATACAGAAATATGAACACGTTCAAAACACGAACAGTCCAGGAGAATTTAAATGGCTGCCATTAATACGAAAGTCAAAAAAGCCGTTATCCCCGTTGCGGGATTAGGAACCAGGATGTTGCCGGCGACGAAAGCCATCCCGAAAGAGATGCTGCCACTTGTCGATAAGCCATTAATTCAATACGTCGTGAATGAATGTATTGCGGCTGGCATTACTGAAATTGTGCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGA > NC_000913/1291223‑1291804 | ggtCGACTGCGCTTGATGTTGTCTGCAGAATGAGCAAACGATAACGCGGGCTAAATTTGCATTACCTGCTAATGTCGGCTGGTGGTACTATCGTCGCCATTCGTATAAGTAATTGTCTTAATTATGCTAACTCGCCTCCTTTTCAGAACTTAGCCCCTTCGGGGTGCTGATATACTGGGATGCGATACAGAAATNTGAACACGTTCAAAACACGAACAGTCCAGGAGAATTTAAATGGCTGCCATTAATACGAAAGTCAAAAAAGCCGTTATCCCAGTTGCGGGATTAGGAACCAGAATg > 2:660855/1‑300 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ggATTAGGAACCAGAATGTTGCCGGCGACGAAAGCCATCCCGAAAGAGATGCTGCCACTTGTCGATAAGCCATTAATTCAATACGTCGTGAATGAATGTATTGCGGCTGGCATTACTGAAATTGTGCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCANTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCNAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGa < 2:536304/300‑1 (MQ=255) ggATTAGGAACCAGAATGTTGCCGGCGACGAAAGCCATCCCGAAAGAGATGCTGCCACTTGTCGATAAGCCATTAATTCAATACGTCGTGAATGAATGTATTGCGGCTGGCATTACTGAAATTGTGCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGa < 1:247803/300‑1 (MQ=255) ggATTAGGAACCAGAATGTTGCCGGCGACGAAAGCCATCCCGAAAGAGATGCTGCCACTTGTCGATAAGCCATTAATTCAATACGTCGTGAATGAATGTATTGCGGATGGCATTACTGAAATTGTGCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCCCCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGTTGAACGGCCTGGGa > 2:198971/1‑300 (MQ=255) | GGTCGACTGCGCTTGATGTTGTCTGCAGAATGAGCAAACGATAACGCGGGCTAAATTTGCATTACCTGCTAATGTCGGCTGGTGGTACTATCGTCGCCATTCGTATAAGTAATTGTCTTAATTATGCTAACTCGCCTCCTTTTCAGAACTTAGCCCCTTCGGGGTGCTGATATACTGGGATGCGATACAGAAATATGAACACGTTCAAAACACGAACAGTCCAGGAGAATTTAAATGGCTGCCATTAATACGAAAGTCAAAAAAGCCGTTATCCCCGTTGCGGGATTAGGAACCAGGATGTTGCCGGCGACGAAAGCCATCCCGAAAGAGATGCTGCCACTTGTCGATAAGCCATTAATTCAATACGTCGTGAATGAATGTATTGCGGCTGGCATTACTGAAATTGTGCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGA > NC_000913/1291223‑1291804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |