| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 275,668 | G→A | G115E (GGA→GAA) | mmuP → | S‑methyl‑L‑methionine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 275,668 | 0 | G | A | 98.6% | 241.5 / NA | 69 | G115E (GGA→GAA) | mmuP | S‑methyl‑L‑methionine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (39/29); total (39/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTCAAAGTGGTCACTATCATCGCCTTTATCATCCTCGGTGGGGCGGCGATTTTCGGCTTTATTCCGATGCAGGATGGCTCGCCCGCGCCGGGGCTGAGTAATATCACGGCAGAAGGCTGGTTCCCGCACGGTGGCTTACCGATTTTGA > NC_000913/275373‑275946 | cgTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGTCGTGATTGGCACATGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTc < 2:303029/300‑1 (MQ=255) aTGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTAc < 1:570945/300‑1 (MQ=255) ttCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTACTGGtt < 1:353012/300‑1 (MQ=255) ttCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCGTCAATACCGGGTACGTCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTACTGGtt < 2:474686/300‑1 (MQ=255) ttCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTACTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTACTGGtt < 2:359221/300‑1 (MQ=255) gATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGt > 1:17391/1‑300 (MQ=255) gATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGt > 2:141287/1‑300 (MQ=255) gATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCAGGt > 1:431199/1‑300 (MQ=255) aTTGGCGCAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTNTCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTNTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTa < 2:525379/300‑1 (MQ=255) acaGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGAATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTc < 1:718141/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |