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Read alignment evidence... | |||||||||||
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gTATTAGGTGATGATAAATCGACTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACAGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCAGATGCCTTCAGATAAGGTGATGCAAGGATTGCAGCTGGAGCTTTCGAATATCAACTAAAACAACAAGGCAAAAACTGGTATTTGAAAAGTTATCAGTCAGTGAATGAGGAGGATAACAGCTCAGAGGGAAATTCAGAATCAACa > 1:648410/1‑300 (MQ=255) gTATTAGGTGATGATAAATCGACTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACAGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCAGATGCCTTCAGATAAGGTGATGCAAGGATTGCAGCTGGAGCTTTCGAATATCAACTAAAACAACAAGGCAAAAAATGGTATTTGACAAGTTATCAGTCAGTGAATGAGGAGGATAACAGCTCAGAGGGAAATTCAGAATCAACa > 2:12265/1‑300 (MQ=255) gTATTAGGTGATGATAAATCGACTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACAGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCAGATGCCTTAAGATAAGGTGATGCAAGGATTGCAGCTGGAGCTTTCGAATATCAACTAAAACAACAAGGCAAAAACTGGTATTTGACAAGTTATCAGTCAGTGAATGAGGAGGATAACAGCTCAGAGGGAAATTCAGAATCAACa > 2:265552/1‑300 (MQ=255) gTATTAGGTGATGATAAATCGACTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACAGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCAAGCAGATGCATTCAGATAAGGTGATGCAAGGATTGCAGCTGGAGCTTTCGAATATCAACTAAAACAACAAGGCAAAAACTGGTATTTGACAAGTTATCAGTCAGTGAATGAGGAGGATAACAGCTCAGAGGGCAATTCAGAATCcaca > 2:243772/1‑300 (MQ=255) aGGTGATGATAAATCGACTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTNAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACAGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCAGATGCCTTCAGATAAGGTGATGCAAGGATTGCAGCTGGAGCTTTCGAATATCAACTAAAACAACAAGGCAAAAACTGGTATTTGACAAGTTATCNGTCAGTGAATGAGGAGGATAACAGCTCAGAGGGAAATTCAGAATCAACAGAAAc > 2:695409/1‑300 (MQ=255) tAAATCGACTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACAGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCAGATGCCTTCAGATAAGGTGATGCAAGGATTGCAGCTGGAGCTTTCGAATATCAACTAAAACAACAAGGCAAAAACTGGTATTTGACAAGTTATCAGTCAGTGAATGAGGAGGATAACAGCTCAGAGGGAAATTCAGAATCAACAGAAACGCCTAcccc < 1:633017/300‑1 (MQ=255) | GGTTAATAATACTGGAGGTGACTTAAACATAATTTCGTCCGACTCTATTCTAAATGGAGCGACTAAACTCGTCAGCGGCACAACCACGCTGAAGCTTTCAGAAAATACAATCTGGAATATGAAAGATGACTCCGTTGTTACCCATCTGACTAATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCCAGCAGATGCCTTCAGATAAGGTGATGCAAGGATTGCAGCTGGAGCTTTCGAATATCAACTAAAACAACAAGGCAAAAACTGGTATTTGACAAGTTATCAGTCAGTGAATGAGGAGGATAACAGCTCAGAGGGAAATTCAGAATCAACAGAAACGCCTACCCC > NC_000913/1220683‑1221264 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |