Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 2,737,689 | IS150 (+) +3 bp | intergenic (+43/‑54) | pheL → / → pheA | phe operon leader peptide/fused chorismate mutase/prephenate dehydratase |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2737689 = | 0 (0.000) | 97 (1.020) | 65/596 | 0.2 | 100% | intergenic (+43/‑56) | pheL/pheA | phe operon leader peptide/fused chorismate mutase/prephenate dehydratase |
? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 2737691 | 0 (0.000) | 71 (0.750) | 46/594 | 0.8 | 100% | intergenic (+45/‑54) | pheL/pheA | phe operon leader peptide/fused chorismate mutase/prephenate dehydratase |
? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
ATGATGAGCTGGAACAGGCGAGTAATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2737986‑2737689 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 ATGATGAGCTGGAACAGGCGAGTAATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTNCCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTG < 2:669962/300‑1 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CTGGAACAGGCGAGTAATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACC < 1:23178/300‑1 GAACAGGCGAGTAATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCAGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCA > 1:158195/1‑300 GAACAGGCGAGTAATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCAACCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCA > 2:143936/1‑300 GTAATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCNCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGA > 1:511898/1‑300 ATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAG > 2:638453/1‑300 ATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAG > 1:231962/1‑300 ATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTACAGCAAGTCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAACAAAGGCCCCCAGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGAACCCACAAAGTTGGACAG > 2:214911/1‑300 GTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCAAGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATCATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTT > 2:77758/1‑300 tGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGTGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACAC < 2:63372/299‑1 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GGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACAC < 1:104648/300‑1 TCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCCATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCAACTCGAAGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTAATCCAGCGCGCTGATTTTCTATCGCAGCGCAAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGG > 2:277984/1‑300 TCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCACGATTTGGGAGGCATTATTGTGTACTGACTCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGG > 2:22774/1‑300 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ATTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCACATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATCCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTCTATTACTGAACTCCTCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCAT > 1:405106/1‑300 TTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATNAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATNTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < 2:547606/300‑1 TTGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < 1:144742/300‑1 ATGATGAGCTGGAACAGGCGAGTAATGTAATGGGCGTCCAGATGGTGCGCTTTACCGAGCGTAATTAATCTTTCCAGCAAATCGCGTTCACGATCAATATCACGTACCGGGCGATGCGAGAGCAGTTTGGCTTTTCCCACCTCGACGGCCAGTTCGCGCCGTTCTGCCAGTAACGCTAATAATTTTTCATCCAGCGCGCTGATTTTCTCTCGCAGCGCCAGTAACGGGTTTTCCGATGTCATAGTGTTGCCTTTTTGTTATCAATAAAAAAGGCCCCCCGATTTGGGAGGCCTTATTGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2737986‑2737689 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |