| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 607,765 | IS150 (+) +3 bp | noncoding (26‑28/60 nt) | sokE ← | small RNA SokE |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 607767 | 1 (0.010) | 96 (1.010) | 60/594 | 0.3 | 99.0% | noncoding (26/60 nt) | sokE | small RNA SokE |
| ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTACTCCCCGCACAACGGCTACTTCTTCGGTTCGTAAGCGAGAACAGCCTTAAACTCAATATTACGTTCCTTCACCGTAAACTCACACAGCGAGTCTCCGACCAGAAGCGTAAATCCCAGCACCGTTAAACACAGCACTATGACTGCCGCAAGGGCATATTTCGTCAGCATGTTTATATTGCCTCCATGCGAAGAAGGGACTACCATCCAAATTGTTCGGGTTTGGAGTGGCAGCCCCAGGGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 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GGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATAC > 1:340940/1‑300 GTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTNTTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAANAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATACG < 2:608249/300‑1 GTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTCAGGATATTTTGATATCTTCTCATACG > 2:76463/1‑300 CGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTACTCCCCGCACAACGGCTACTTCTTCGGTTCGTAAGCGAGAACAGCCTTAAACTCAATATTACGTTCCTTCACCGTAAACTCACACAGCGAGTCTCCGACCAGAAGCGTAAATCCCAGCACCGTTAAACACAGCACTATGACTGCCGCAAGGGCATATTTCGTCAGCATGTTTATATTGCCTCCATGCGAAGAAGGGACTACCATCCAAATTGTTCGGGTTTGGAGTGGCAGCCCCAGGGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608059‑607765‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATACG < NC_000913/3722075‑3721777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |