Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 897,642 | G→A | V187I (GTC→ATC) | potI → | putrescine ABC transporter membrane subunit PotI |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 897,642 | 0 | G | A | 98.4% | 190.6 / NA | 63 | V187I (GTC→ATC) | potI | putrescine ABC transporter membrane subunit PotI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (35/27); total (36/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGCAAGACGTGGCTGAAGAC > NC_000913/897352‑897933 | tggtgcGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGc < 1:563340/300‑1 (MQ=255) ttGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCgatga > 1:630168/1‑300 (MQ=255) tGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCgatgat < 1:272977/300‑1 (MQ=255) tGGCAGGGTTCGCGGATCAAATTGCTTTGCCTTGATGATCACCGCGCCGCGGGTAAGGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATACCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGTTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCgatgat < 2:398936/300‑1 (MQ=255) aGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATg < 1:415028/300‑1 (MQ=255) gCCTTTATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTNTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGA‑GACA‑CCGATGACAACNTTTTTCATCATGAAGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTa > 2:643272/1‑300 (MQ=255) tttATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGT‑GACG‑CCGCTAAAAATGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGTGATCATTTCTGGCTGGTTACTg > 2:45638/1‑300 (MQ=255) tATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGc > 1:220711/1‑300 (MQ=255) cACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTAc < 1:639857/300‑1 (MQ=255) ggTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑TACG‑CCGCTGAAAGTGTTTGTAGTCATTAAGATAACGGTGATCGTGACCGCGATCATTTATGGTTGGTTACTGGCGTTTACTTTGTCGCTtga > 2:261598/1‑300 (MQ=255) tGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGT‑GACG‑CGGCTGAAAGTGTTTTTCATCGTTAAGCTAACGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTCACTTTGTCGCTTGATGATc > 2:5257/1‑300 (MQ=255) tGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATc > 1:60386/1‑300 (MQ=255) cAGATGTCATTACGGTCTTGTCGTTTTGGGTATTGTTCGTCGCGTTTGCTCATACCGTTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATCCTCACCATCTGGCTCGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTgg < 2:414629/300‑1 (MQ=255) gattttntcactggttgttcgtttttgttATTATTTGTCGCGCTTGCTCATGCCNTTGGCTGGCCTGCGGACCGTGGTATGCTCACCATCTGGCGGGCGCATGTCACTTTTTGTACAGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTgggg < 2:573763/276‑3 (MQ=255) catcaCGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GCCG‑CCGCTGACCATGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTATTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGc > 2:93302/1‑300 (MQ=255) ggCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCttt > 1:137857/1‑300 (MQ=255) cTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GCCA‑CAGCTGAAAGCGTTTTTCATCATTACGATACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACGTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTccggg > 2:221843/1‑300 (MQ=255) gttATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACTGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTccgggccggg > 1:610796/1‑300 (MQ=255) gttATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTccgggccggg > 1:284189/1‑300 (MQ=255) ttCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGccacc < 1:137751/300‑1 (MQ=255) gcgcTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTa > 1:421980/1‑300 (MQ=255) cTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGGTCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CAGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCg < 1:95752/300‑1 (MQ=255) cTCATGCCATTGGCTGGCCTGCCTGCTGCGGTATGCTCACCATTTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTAGGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCCGAAACTGAATCACTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGc < 2:657379/300‑1 (MQ=255) tggctggcCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTc > 1:154831/1‑300 (MQ=255) ggcCTGCGGACCGCGGTATGCGCACCATCTGGCTTGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATGGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCg < 1:111466/300‑1 (MQ=255) gCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGACAGTGTTTTTCATCATTACGCTAACGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGNTGGTTACTGGCTTTTAATTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCAGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCgg > 2:608239/1‑300 (MQ=255) gACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATg < 1:177854/300‑1 (MQ=255) cgGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGt < 1:456318/300‑1 (MQ=255) tGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATc < 1:538971/300‑1 (MQ=255) ggctggcGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACg > 1:604177/1‑300 (MQ=255) gctggcGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGc < 1:439658/300‑1 (MQ=255) gTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATT‑‑TTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑TCAG‑CATCTGACAATAGTTTTCATCATTAAGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCGTTTAATTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACATTACCGATGCTGGTCTTTTACAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGAAACAtt > 2:431746/1‑300 (MQ=255) ttGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTNCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGT‑GAAG‑CCGATGAAAACGTTTTTCATCATTACGCTAACGNTGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCt > 2:491377/1‑300 (MQ=255) ggCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑‑TCGACATATCACCATACGTGTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTNTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGgcgc > 2:597906/1‑300 (MQ=255) aTGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCg > 1:268391/1‑300 (MQ=255) gCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAAtt < 1:563675/300‑1 (MQ=255) cGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTg < 1:93304/300‑1 (MQ=255) gTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTc > 1:222931/1‑300 (MQ=255) cttcAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑TCCC‑CCTCTGACCACACTTTTCATCATTAAGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTAATTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGTGGTCGGAATTGTCGGATTTATCg > 2:14331/1‑300 (MQ=255) tcAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGcc < 1:572743/300‑1 (MQ=255) gggAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑TCAG‑CAGCTGACCGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTATGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGa > 2:413394/1‑300 (MQ=255) ggAACTGGATCGCGCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTTGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGAt < 1:80429/300‑1 (MQ=255) agAACTGGATCGCGCGAGATAAGAAGCATCGGTGGATCTCGGTGT‑GACG‑CCTCTGAAGGTGTTTTTCATCATTACACTACCGATGAGCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCGGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCGGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAGTCAACGCCCTGGCAGCATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCGGGTATCGGAt < 2:139400/299‑1 (MQ=255) gAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCTCAC‑‑CCTCTAACCACACCTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCACGCGATCACTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCAGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGAtt > 2:201631/1‑299 (MQ=255) gAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑TCGG‑CAGCTGAGGGTGTTTTTCATCATTAAGCTAACGATGATCATGCCCGCGATCATTTATGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGCCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCNACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATg > 2:503627/1‑300 (MQ=255) gAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATg > 1:599644/1‑300 (MQ=255) gAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCACTGGCAACATTGATCCTAGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATg > 1:135579/1‑300 (MQ=255) aactgaaccacTCGAGAGAAGAAGCAGCGATGGATCCCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTGTGTCGCTTGATGATCTGGTGGTCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATgg < 2:219461/290‑1 (MQ=255) cTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCt > 1:437546/1‑300 (MQ=255) gCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GCAG‑CGGCTAAAAGTGTTTTTAATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAg > 2:674560/1‑300 (MQ=255) cGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGT‑TCCG‑CCTCTGACCACATTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAGATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGaaa > 2:650667/1‑300 (MQ=255) tAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAAc < 1:615497/300‑1 (MQ=255) gcGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATAcgc > 1:149549/1‑300 (MQ=255) gATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATc > 1:366525/1‑300 (MQ=255) aTCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTTTGGCTGGTTACTTGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCATAAAAACAGCGGATACGCGACATcc < 2:117594/300‑1 (MQ=255) gTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGANATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTg > 1:470270/1‑300 (MQ=255) gTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGG‑AGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGc > 1:250172/1‑300 (MQ=255) cg‑ccgcTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGCAAGAc < 1:374349/300‑1 (MQ=255) cg‑ccgcTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTCTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGCAAGAc < 2:415329/300‑1 (MQ=255) cg‑ccgcCGAAAGTGTTTTTCATCACTACGCTACCGATGATCATGCCCTCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTTTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCATCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGCAAGAc < 2:592786/300‑1 (MQ=255) g‑ccgcTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAGAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGTAAGACg > 2:581412/1‑300 (MQ=255) g‑ccgcTGAAAGTGTTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGCAAGACg > 2:581403/1‑300 (MQ=255) tgtTTTTCATCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGCAAGACGTGGCTGAAGac < 1:591871/300‑1 (MQ=255) | TGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCGCTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTGTCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGC‑GACG‑CCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTACGCTACCGATGATCATGCCCGCGATCATTTCTGGCTGGTTACTGGCTTTTACTTTGTCGCTTGATGATCTGGTGATCGCCAGCTTTGTTTCCGGGCCGGGAGCCACCACGTTACCGATGCTGGTCTTTTCCAGCGTGCGGATGGGGGTGAATCCGGAAATCAACGCCCTGGCAACATTGATCCTCGGCGCGGTCGGAATTGTCGGATTTATCGCCTGGTATCTGATGGCTCGCGCAGAAAAACAGCGGATACGCGACATCCAGCGTGCAAGACGTGGCTGAAGAC > NC_000913/897352‑897933 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |