| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,541,225 | G→A | A273A (GCG→GCA) | feoB → | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,541,225 | 0 | G | A | 98.2% | 196.5 / NA | 56 | A273A (GCG→GCA) | feoB | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (25/30); total (25/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCTGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCGCTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACACGCTCCACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGAC > NC_000913/3540930‑3541513 | tGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCTGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCAGTAg < 1:447311/300‑1 (MQ=255) aTTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCTGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCAGTAGATa > 1:306124/1‑300 (MQ=255) aTTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCTGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTAACAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCCACACTGCAGTAGATa > 2:450490/1‑300 (MQ=255) gcGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCNCTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCTGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTANGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCAGTAGATaaaa > 2:497801/2‑300 (MQ=255) aCGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCTGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCAGTAGATaaaa > 1:222155/1‑300 (MQ=255) ctgctCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCATGCCAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTATGCGTAATGAGATGGAAGATCCGGCGCTGCACATCGCCAATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGACACCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCAGTTTCACCACTGCAGTAGATAAAATtgtgtttaac > 2:364214/1‑294 (MQ=255) cAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCGGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCAGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGtgt < 2:42533/300‑3 (MQ=255) 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cGGCAGAACCCATCCGTTTCACCACTACGGTAGATAAAATCGGGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTACCGATTTTCCTCTTGGTGATGGACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCGCTATTTGGGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACACGCTCCACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTcc < 2:303527/300‑1 (MQ=255) gAACCCAGCCGTTTCACCACTGCAGTAGAGAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGTTCTGCCGATTTTCCTCTTTTTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCGCTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACACGCTCCACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTTTTCCTCtcc < 2:432892/300‑1 (MQ=255) tttCACCACTGCAGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCGCTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACACGCTCCACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGa > 1:123083/1‑300 (MQ=255) ttCACCACTACAGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCGCTATTTGNGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACANGCTCCACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGAc < 2:473467/300‑1 (MQ=255) | TGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCCGCTGAAACAACGTCGCTGGCTGGGCCTGCAAATGCTGGAAGGCGATATCTACAGCCGCGCCTACGCCGGTGAAGCGTCGCAGCATCTGGATGCCGCCCTCGCCCGTCTGCGTAATGAGATGGACGATCCGGCGCTGCACATTGCCGATGCGCGTTACCAGTGCATTGCTGCCATCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCGCTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACACGCTCCACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGAC > NC_000913/3540930‑3541513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |