| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,540,703 | G→A | E99E (GAG→GAA) | feoB → | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,540,703 | 0 | G | A | 97.8% | 321.4 / NA | 92 | E99E (GAG→GAA) | feoB | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base A (32/57); minor base C (1/1); total (33/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCTTAATTGGTAATCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACATCCC > NC_000913/3540425‑3540996 | ggCTTAATTGGTAATCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTATAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCNCTAACCACCATCTCCTCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGAACTGCTGATTAACGTGGTGAATGCGTCTAACCTTGACCGCAACCTGCACCTGACGcca > 2:165393/1‑298 (MQ=255)ggCTTAATTGGTAATCCAAATCCTGGCAAGANAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACATCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCANCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTAACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTa > 2:499533/1‑300 (MQ=255) gCTTAATTGGTAATCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGNTCGATGAGCAAATCGCATGTAACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTACCCTTGAACGTAACCTGTCCCTGACGCTAc > 2:610982/1‑300 (MQ=255) tAATTGGTAATCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTACAAc < 1:155260/300‑1 (MQ=255) aTCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAAc < 2:390593/300‑1 (MQ=255) gACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACTTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCAt < 1:566049/300‑1 (MQ=255) gACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCAt < 1:117910/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |