| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,279,461 | A→G | H183R (CAT→CGT) | kbaZ → | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,279,461 | 0 | A | G | 98.5% | 246.9 / NA | 65 | H183R (CAT→CGT) | kbaZ | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (30/34); minor base T (0/1); total (30/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTCAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTGGTGATTGA > NC_000913/3279169‑3279746 | aTTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTCAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAAcc < 1:25225/300‑1 (MQ=255) 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aaCCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCt > 2:662004/1‑300 (MQ=255) ccTGTATTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGATGGAAGCCCATCGTCAAGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTAGAAAACTACGAAACGCtaa > 2:18234/1‑298 (MQ=255) cacTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAgcg > 1:545255/1‑300 (MQ=255) 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ccGATCTGGAGGATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGAtt < 2:625891/300‑1 (MQ=255) tGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCaaa < 2:620860/300‑1 (MQ=255) ggAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAAc > 1:232483/1‑300 (MQ=255) 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ATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTCAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTGGTGATTGA > NC_000913/3279169‑3279746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |