| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,053,212 | C→T | G103R (GGA→AGA) | ubiH ← | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenol 4‑hydroxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,053,212 | 0 | C | T | 98.5% | 249.1 / NA | 68 | G103R (GGA→AGA) | ubiH | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenol 4‑hydroxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (45/22); minor base G (0/1); total (45/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTCATGCGCAACGGAAGTAGCAACGTTGGCAATCACGGCCAGTTGTTCGTAAGGCTCCTGCTGCCAGTCAACGCCGCACGCGGTGGCTAACGCTGAATGGGTGCCATCAGCTGCTACCAGCACGCGGCCCGTCAGCGTCTCGCCACTCTCCAGCGTCACTTCAACGTGACTCTGAGTACGGGCAACGTTAGCCACGCGATCAGGGCAATGCAGCGTTACGCCAGGTGCTTTACGCAGCAATGCAAACAGCCGTTGCCCGACATTGTGCAATTCGACAACCTGTCCCAGCGCCGCCAGTTGGTAATCTTCTGCGGCGAGGGTGACAAATCCAGCGTGACCACGATCGCTGACATGCACGGTGGTGATGGCAGTTGCGCAATCCGCCAGAGATTGCCAGACGCCGATGCGCGCCAGTTGCTGACAGGTACCCGCCGCCAGCGCTATCGCTCGTCCATCAAAGCCCGGATGAGCATGTGACTCTGGCGCAGTCGCTTCAATCAAATGTACCGGCAGCGCCCCGTGACTTAACCGGGAAATAGCCAGCGCCAGCGTCGCGCCCGCCATGCCGCCACCGACG > NC_000913/3052928‑3053504 | ttCATGCGCAACGGAAGTAGCAATGTTGGCCATCACGGCCAGTTGTTCGTAAGGCTCCTGCTGCAAGTCAACGCCGCACGCGGTGGCTAACGCTGACTGGGTGCCGTCAGCTGCTACCAGCACGCGGCCCGTCAGCGTCTAGCCAATTTCCAGCGTCACTTAAACGTGAATCTGAGTACGGGCAACGTTAGCCACGCGATCAGGGCAATACAGCGTTCCGACAGGTGCTTTAAGCAGCAATGCAAACAGCCGTTGCCCGACATTGTGCAATTCGACCACCTGTCTCAGcgccgacaatca > 2:138664/1‑293 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |