| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,174,817 | IS1 (+) +9 bp | coding (225‑233/453 nt) | gatA ← | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 103 (1.150) | 71/598 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2174817 = | 0 (0.000) | coding (233/453 nt) | gatA | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 88 (0.980) | 68/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2174825 | 0 (0.000) | coding (225/453 nt) | gatA | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component | |||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
GCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATG > NC_000913/2174526‑2175124 | gaacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCCTTAAc < 2:671085‑M2/9‑1 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aCGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgt > 1:643650‑M2/1‑54 (MQ=255) gaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCg < 2:681324‑M2/263‑1 (MQ=255) atcatcatcCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaaccgaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgcc < 2:592121‑M2/300‑255 (MQ=255) ttaatacgttggcgtcactaccGGCCTTACCAGATACATGACTGACGACTTGGCATGAATCGCCTCGCAATGTGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCGTTGGCGAGCATCGCATTACCGATACGGGTTAAAACGTCGCTACGATCGACAAAAGAAGTTCCGCTACAAACAAACAGGTTAGTCATATACCATCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCACAAAAc < 2:100402‑M2/278‑1 (MQ=255) ataagttggagtcattaccGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAAcatc < 1:84761‑M2/281‑1 (MQ=255) aTGAACTTTATTGGTTGGCCTTAACggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgg > 2:142164‑M2/1‑25 (MQ=255) 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GCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATG > NC_000913/2174526‑2175124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |