New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1286906 | 53 (0.590) | 9 (0.110) | 6/558 | 7.4 | 16.9% | coding (198/276 nt) | ychS | putative uncharacterized protein YchS |
? | NC_000913 | 1287557 = | 39 (0.460) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTT > NC_000913/1286611‑1287201 | tATCCGACCTACAGTGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGTAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:615048/300‑1 (MQ=255) tATCCGACCTACAGGTGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGTGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTc < 2:271185/300‑1 (MQ=255) ccGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgc < 1:457364/300‑1 (MQ=255) gACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGTAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:542379/300‑1 (MQ=255) gACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:72200/300‑1 (MQ=255) gACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAG‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAcccaacgc > 2:300993/1‑293 (MQ=255) aCCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTccacgct > 2:404497/1‑294 (MQ=255) aCCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTATCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTT‑GGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaccttcg > 2:661285/1‑290 (MQ=17) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGTGTGACGGATTCCTCCGCGCttc > 1:566830/1‑298 (MQ=255) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcccccacgctac > 1:333529/1‑288 (MQ=255) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTT‑GGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgcaccttcgaa > 2:374037/1‑288 (MQ=17) aCAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGAGAG‑TTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcacccacgctacgt > 2:304022/1‑286 (MQ=18) aCAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 1:14779/300‑1 (MQ=255) cggaTATTGTATGCCCTGTAAACGTGTTGCCATCGTGCAAGATTCGCTCGGACTAACAGGTGTTGATTATTTAATGAATCGATGTTGGTGTGGGAAGAATTACTTAGCGCTGAGTGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCGGCGCTCTCGCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGGCGAAGTTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAGTATGGGATTGCGGAGTCGTGTGAGAG‑TTCCGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGc < 2:617202/299‑1 (MQ=17) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGcc > 1:693530/1‑300 (MQ=255) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCACGCTTCGcc > 1:565365/1‑300 (MQ=255) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAA‑TTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgccccttcgaagtctataacg > 1:429213/1‑278 (MQ=17) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTT‑GGGAAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgcaccttcgaagtcgctgacg > 2:656031/1‑278 (MQ=14) tatTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACACTCTCTCGATGGTGCTCCAGTCGACACCT‑GGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGAATGGGCAGGGTATTTGATTGCGGATTCGTTTGGGAA‑TTCAGGGGGTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGGAGGATTAGTAAACTCTGCGCGATTCGCCCtt > 2:198616/1‑300 (MQ=18) atTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCCCATCGCTACGCGCTTCGCCCTTc > 1:340371/1‑300 (MQ=255) ttGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGACTTTTGAAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGTGCTGCGCGCTTCGCCCTTCg > 2:266959/1‑300 (MQ=255) tGTAGGCCCGGTAAACGTTGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGTAATCGATGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCgg < 2:35239/300‑1 (MQ=255) cGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAG‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACCCCGCGCTACGCGCCTAACCCCTCGTGTCGTTGc > 2:385542/1‑300 (MQ=18) cGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGTGCCTCGCCCCTAAGGTCGTTGc > 1:447847/1‑300 (MQ=255) tggtgCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGNGGAAGGATTACTCAACGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTNTGGCaa > 2:574361/1‑300 (MQ=255) 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aGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGGTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCTTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTTAAAGTGATAGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc < 1:219901/300‑1 (MQ=255) aGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc < 1:567635/300‑1 (MQ=255) tgttggtggTGTAAGGATTACTCATCTCTGCTCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCGACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCACCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATGTGATTGCGGAGTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 2:193051/297‑1 (MQ=17) tgttggtggGGGAAGAATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTNCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 2:607877/297‑1 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCAACGCTGCGCGCCTAGCCCCCAAGGTCGTTGCCTGCGACACCGCCCTCTCGCTGACACTCACGTAGCACATTAGCCGAAGCTTATCATCCTTCCACGcctg > 2:420268/1‑297 (MQ=14) gggAAGAATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATG‑TGGTGGGGGAAGGATTCCTCAGCGCTGCACGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCCCTCTCGCTGGAGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAat > 1:636903/1‑300 (MQ=14) 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gcTCAAGTCGA‑ACTTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:669908/300‑1 (MQ=255) gcTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:201054/300‑1 (MQ=255) gcTCAAGTCAA‑ACCTTGGTCGAATCTTCTCATCTTTCCCCGCTTGGTCAGAATATGTGATGGTGGGTTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTGTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACACTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTTAGA‑GTTCAGGTACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTc < 2:119053/300‑1 (MQ=17) gttCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAGTGCTTGATTGCGGAGTCGTTTGAGAG‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGTGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:313347/298‑1 (MQ=255) ggTCGA‑ACCTTGGTTGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATACTTGATTGCGGATTAGTGGGAGAA‑TTCCGGGGCTTGGGAAAGTGATGGTGGTGGGTGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:315513/299‑1 (MQ=17) a‑aCCTTGGTCGAAGTTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCATGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 1:33052/300‑1 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑ACTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACCCAGCGCTgcgcatctggccctccggg > 2:199238/1‑285 (MQ=255) tgtGATTGCGGATGAGTTGTAGAG‑TTCCGTGGCTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGNGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCTAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTANTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTg < 2:634308/298‑1 (MQ=14) cGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGTCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGC‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGTTGGGGGACGGAGTATTCCGCGCTACATGCTTAGCCCTTTGTGTCGTGGTCTTCGACGACGCTCTCTCgatcgcactcaatccaag > 2:47402/1‑283 (MQ=14) cGGGGCTTTGGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGTAAGGATTACTCAGCACTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGc < 1:278565/300‑1 (MQ=255) cttgtGAAAGTGATGGGGGTGGGGGAAGGATTATTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATGTGATTGCGGATGCGCGTGAGA‑GTTCAGGGACGTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTtctc < 1:344047/296‑1 (MQ=17) gtGAAAGTGATGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATc < 1:262485/299‑1 (MQ=255) gaaatggATGTTGGTGGGTGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCTCTTCGGGGTGTTGCTTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACTTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATGTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCt < 2:677841/294‑1 (MQ=14) aaaggATGGTAGGGGGGTAAGGATTACTCAATGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTTGTTGCCTGCGGCGGCGCTCTCTCGCCGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAAGGTGGGATTGCGGATTCGCGTTAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGTAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 2:248083/296‑1 (MQ=17) ggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATGTGATTGCGGATTCGCTGGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 1:613090/300‑1 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCAGAATGGGCAGAATAttt > 1:299820/1‑300 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCAAATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAttt > 1:343488/1‑300 (MQ=255) | TATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGA‑ACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTT > NC_000913/1286611‑1287201 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |