| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 332,367 | IS2 (–) +5 bp | [pdeL] | [pdeL] | |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 332367 = | 0 (0.000) | 101 (1.120) | 70/598 | 0.1 | 100% | intergenic (+491/‑4) | yahV/pdeL | protein YahV/DNA‑binding transcriptional regulator/c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeL |
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| * | ? | NC_000913 | = 332371 | 0 (0.000) | 106 (1.190) | 77/594 | 0.0 | 100% | coding (1/1089 nt) | pdeL | DNA‑binding transcriptional regulator/c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeL |
| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GTAGTGGGAAATTATAAATATTGAAATAGTCCAACTACTTCTTTATTACCAAAAATGAGTATCTGAATTTTAATATTGCATTCTTGCGTGATTATCTCCTGAGTTTGACTTGTGATTACCTTTTTAAGGTATTTAGCGTAACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGATGTTATACGTATGGCATCGCTGATGTTTATGGTTACCCCTTATGTGTGCTCAGGAATCGACAGGTAATCACTCATACTGAACAGCGATAAAAGATAAAGGTGTGTTCATGAATTCATGTGATTTTCGTGTTTTTCTGCAAGAGTTCGGTACAACGGTTCATTTGTCATTGCCTGGTAGCGTATCCGAGAAAGAACGACTGCTACTCAAGCTGCTGATGCAGGGAATGTCTGTAACAGAAATATCACAGTACAGAAATCGCAGTGCAAAGACAATTTCACATCAAAAGAAACAGCTCTTTGAGAAACTGGGGATTCAGAGCGATATTACTTTCTGGCGCGATATTTTCTTTCAGTACAATCCGGAGATCATATCCGCCACGGGGAGTAATAGTCACAGATATAT > NC_000913/332068‑332666 | ggaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGtt > 2:408394‑M1/298‑300 (MQ=255) gggggAAATTATAAATATGGAAATAGTCCAACTACTTCTTTATTACCAAAAGTGAGTATCTGAATTTTAATATTGCATTCTTGCGCGATTATCTCCTGAGTTTGACTTGTGATTACCTTTTTAAGGTATTTAGCGTAACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATATTGATGTGGGATGTTATACGTATGGCATCGCTGATGTTTATGGTTACCCCTTATGTGTGCTCAGGAATCGACAGGTAATCACTCATACTGAACAGCGATAAAAGATAAAGGTGTGTTc < 1:36188/298‑1 (MQ=255) aacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccntctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactattacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggtcagtctaGTTCATGa < 2:165080‑M1/8‑1 (MQ=255) aacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTCATGa < 1:551252‑M1/8‑1 (MQ=255) atatTGAAATAGTCCAACTACTTCTTTATTACCAAAAATGAGTATCTGAATTTTAATATTGCATTCTTGCGTGATTATCTCCTGAGTTTGACTTGTGATTACCTTTTTAAGGTATTTAGCGTAACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGATGTTATACGTATGGCATCGCTGATGTTTATGGTTACCCCTTCTGTGTGCTCAGGAATCGACAGGTAATCACTCATACTGAACAGCGATACAAGATAAAGGTGTGTTCAtggatttgcccct > 1:265520‑M1/1‑287 (MQ=255) atatTGAAATAGTCCAACTAATTCTTTATTACCAAAAATGAGTATCTGAATTTTAATATTGCATTCTTGCGTGATTATCTACTGAGTTTGACTTGTGATTACCTTTTTAAGGTATTTAGCGTAACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGATGTTATACGTATGGCATCGCTGATGTTTATGGTTACCCCTTATGTGTGCTCAGGAATCGACAGGTANTCACTCATACTGAACAGCGATAAAAGATAAAGGTGTGTTCAtggatttgcccct > 2:511922‑M1/1‑287 (MQ=255) tatTGAAATAGTCCAACTACTTCTTTATTACCAAAAATGAGTATCTGAATTTTAATATTGCATTCTTGCGTGATTATCTCCTGAGTTTGACTTGTGATTACCTTTTTAAGGTATTTAGCGTAACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGATGTTATACGTATGGCATCGCTGATGTTTATGGTTACCCCTTATGTGTGCTCAGGAATCGACAGGTAATCACTCATACTGAACAGCGATAAAAGATAAAGGTGTGTTCAtggatttgccccta > 1:198335‑M1/1‑286 (MQ=255) 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GTAGTGGGAAATTATAAATATTGAAATAGTCCAACTACTTCTTTATTACCAAAAATGAGTATCTGAATTTTAATATTGCATTCTTGCGTGATTATCTCCTGAGTTTGACTTGTGATTACCTTTTTAAGGTATTTAGCGTAACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGATGTTATACGTATGGCATCGCTGATGTTTATGGTTACCCCTTATGTGTGCTCAGGAATCGACAGGTAATCACTCATACTGAACAGCGATAAAAGATAAAGGTGTGTTCATGAATTCATGTGATTTTCGTGTTTTTCTGCAAGAGTTCGGTACAACGGTTCATTTGTCATTGCCTGGTAGCGTATCCGAGAAAGAACGACTGCTACTCAAGCTGCTGATGCAGGGAATGTCTGTAACAGAAATATCACAGTACAGAAATCGCAGTGCAAAGACAATTTCACATCAAAAGAAACAGCTCTTTGAGAAACTGGGGATTCAGAGCGATATTACTTTCTGGCGCGATATTTTCTTTCAGTACAATCCGGAGATCATATCCGCCACGGGGAGTAATAGTCACAGATATAT > NC_000913/332068‑332666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |