| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,282,332 | (A)5→6 | coding (744/1293 nt) | yjcF ← | pentapeptide repeat‑containing protein YjcF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,282,332 | 1 | . | A | 96.6% | 522.5 / 13.0 | 147 | coding (744/1293 nt) | yjcF | pentapeptide repeat‑containing protein YjcF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/2); new base A (79/62); total (82/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAGGTGTGAAA > NC_000913/4282036‑4282630 | gaacagTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATC‑T‑aaa‑aaatt > 2:219312/1‑297 (MQ=255) cagTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGa > 1:617094/1‑300 (MQ=255) gTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGaat > 1:239612/1‑300 (MQ=255) gCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTAt > 1:89791/1‑300 (MQ=255) aaaTTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTAtt > 2:359118/1‑300 (MQ=255) aaTTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGTAACGTGTTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAGGTTTATATTCTGGAGGGTTGATTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTGTAGAGAAGCTAAGGTCTGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTGCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAGTTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTc < 2:3863/300‑1 (MQ=255) aaTTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGATATTTTTAATATTGGCTCTATTc < 1:122171/300‑1 (MQ=255) tAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACACATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATGTTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCAtt < 2:13804/300‑1 (MQ=255) aCATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCAttgt < 1:249110/300‑1 (MQ=255) aCATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCAgtgt < 1:414031/300‑1 (MQ=255) aGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAATGTGTTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCAt < 2:93653/300‑1 (MQ=255) aGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAANAA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTNTTGCAt > 2:562512/1‑300 (MQ=255) aGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCAt > 2:204398/1‑300 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTAGCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATNTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTa > 2:508711/1‑300 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTa > 1:443802/1‑300 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAAATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTATTGCATCGTa > 2:300460/1‑300 (MQ=255) tAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAANGTTAATTAAATCAAGTTTATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAAt < 2:152294/300‑1 (MQ=255) tAGAGTCGGTACATACAACCGCTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAATAGTTTGCTATCAAGTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAAATTTACCTCAGTCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTGATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAAt < 2:48394/300‑1 (MQ=255) gagTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTCGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTg < 2:416607/300‑1 (MQ=255) cATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTNAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTNCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATATTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCAt > 2:558068/1‑300 (MQ=255) atatAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATCACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTGTTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATa > 2:101883/1‑300 (MQ=255) aaCCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCgg < 1:593762/300‑1 (MQ=255) aaCCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATNAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGNATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCgg < 2:640525/300‑1 (MQ=255) aaCCATTGCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTTGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATGACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCgg < 2:292180/300‑1 (MQ=255) cATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAAc < 1:358738/300‑1 (MQ=255) aTTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGaaaa > 2:369459/1‑298 (MQ=255) aTTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACa > 1:118456/1‑300 (MQ=255) tttCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACAt < 1:609150/300‑1 (MQ=255) aCGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTaga > 2:395924/1‑300 (MQ=255) cgcaTTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGATAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTagag < 2:352829/297‑1 (MQ=255) tGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCgt > 1:336989/1‑300 (MQ=255) gTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTNCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCgtc < 2:502646/300‑1 (MQ=255) aaaaGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATc < 1:694181/300‑1 (MQ=255) cAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTNTTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGNGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGCTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg > 2:495888/1‑300 (MQ=255) cAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATNAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCNTAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg < 2:632257/300‑1 (MQ=255) cAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg < 1:36906/300‑1 (MQ=255) cAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg > 1:389538/1‑300 (MQ=255) cAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCAGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg > 1:544539/1‑300 (MQ=255) cAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCNAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg < 2:607407/300‑1 (MQ=255) cAATGAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTGAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg < 2:21854/300‑1 (MQ=255) tttATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATANGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAANCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCgag < 2:541545/300‑1 (MQ=255) atatTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAAt < 1:160833/300‑1 (MQ=255) atTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATCTTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATAc > 1:109199/1‑300 (MQ=255) atTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATAc > 1:585511/1‑300 (MQ=255) cTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAAt < 1:227002/300‑1 (MQ=255) gggTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TCAAA‑AA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCa > 1:366793/1‑300 (MQ=255) gggTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCa > 1:262417/1‑300 (MQ=255) gCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGNATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTNAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAg > 2:485908/1‑300 (MQ=255) gCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATTGAGAATCCAATTATCAAAAAg > 2:84279/1‑300 (MQ=255) gCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCaaaacg > 2:423720/1‑298 (MQ=255) aTTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTAttt > 1:601716/1‑300 (MQ=255) ggTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTcc > 1:127360/1‑300 (MQ=255) ggTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAAAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTcc > 2:534504/1‑300 (MQ=255) acacGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGNTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTNAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTAt > 2:645590/1‑300 (MQ=255) acacGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTAt > 1:254294/1‑300 (MQ=255) cGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGc > 1:143218/1‑300 (MQ=255) cAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAAt > 2:680004/1‑300 (MQ=255) gATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTa > 1:647093/1‑300 (MQ=255) aGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAAt > 1:67174/1‑300 (MQ=255) gTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGNACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGtt > 1:485355/1‑300 (MQ=255) gTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGtt > 1:517892/1‑300 (MQ=255) ggTTAATTAAATCGAGTTTAGAGAAGCTGAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATTGCGCGATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCGAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCCCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCGAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATAc < 2:305529/299‑1 (MQ=255) taaATCAGGTTTAGAGGAGCTAAGGTCTGCTCTAAATAAATTAATATATTGCGCNATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATNATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 2:647951/300‑1 (MQ=255) taaATCAAGTTTATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATGTGNATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 2:605630/300‑1 (MQ=255) aaaTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACa > 1:576396/1‑300 (MQ=255) aaTCAAGTTTAGATAAGCGAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGNATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGNACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 2:460209/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 1:35577/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGGATGCCATAGA‑AAA‑AA‑TTTGAAGAATCAAGGAAGGTATTTGTAATAGTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATGTAGAGTGCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTGTATACATATGACAg < 1:449519/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAAGAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 1:304367/300‑1 (MQ=255) aTCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCNTTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGANCATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGt < 2:474860/300‑1 (MQ=255) cAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTTTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTcc < 1:285083/300‑1 (MQ=255) ttAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGaaa < 1:690575/300‑1 (MQ=255) ttAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAANTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTANAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGaaa < 2:496095/300‑1 (MQ=255) gagaAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAAt > 1:338919/1‑300 (MQ=255) aGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCg > 2:525203/1‑300 (MQ=255) tCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAg < 1:572939/300‑1 (MQ=255) gCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCt > 1:174783/1‑300 (MQ=255) aaataaatTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAAc > 1:429964/1‑300 (MQ=255) aaataaatTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTNGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAAc > 1:508162/1‑300 (MQ=255) aataaatTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGTAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAAcc < 2:587477/300‑1 (MQ=255) aataaatTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAAcc < 1:544286/300‑1 (MQ=255) cTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGAt > 2:18483/1‑300 (MQ=255) aCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATc < 2:142536/300‑1 (MQ=255) aCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATc > 1:48087/1‑300 (MQ=255) aCTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATGTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGTCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATc < 1:407049/300‑1 (MQ=255) taAAGATTTATCTCAGCCATGTAGGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAATGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGGTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGGTGTATACATGTTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATc < 2:112506/300‑1 (MQ=255) aGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTNTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCttt > 1:502777/1‑300 (MQ=255) gATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCACAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTACAACCTGCAAAATTTGAATTGGATAAATCTTCATCTTTa > 2:34584/1‑300 (MQ=255) aCCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCAc < 1:205443/300‑1 (MQ=255) aGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAAGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATAc < 1:97005/300‑1 (MQ=255) gCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATAcc > 1:145432/1‑300 (MQ=255) gCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATAcc > 2:237211/1‑300 (MQ=255) gCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCCTCATCCTTAATCAcaacacc > 2:109234/1‑294 (MQ=255) cATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCtt < 2:325117/300‑1 (MQ=255) aTGTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCttt > 1:383520/1‑300 (MQ=255) gTATGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCa > 2:194991/1‑300 (MQ=255) aTGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAgg > 2:53179/1‑300 (MQ=255) tGCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGc < 1:517766/300‑1 (MQ=255) gCCATA‑T‑AAA‑AAATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCt < 1:60016/300‑1 (MQ=255) tataaaa‑aa‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATGGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAgg < 2:586191/296‑1 (MQ=255) | GAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTTAGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑T‑AAA‑AA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAGGTGTGAAA > NC_000913/4282036‑4282630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |