Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 355,229 | G→A | G103E (GGA→GAA) | codB → | cytosine transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 355,229 | 0 | G | A | 97.6% | 133.1 / ‑6.5 | 42 | G103E (GGA→GAA) | codB | cytosine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (24/17); minor base T (1/0); total (25/17) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
GACGTTCGTCATGCTGGGATTAACCTTCTTTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAGCTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGGAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAA > NC_000913/354990‑355470 | gACGTTCGTCATGCTGAGATTAACCTTCTTTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTg > 1:299821/1‑251 (MQ=255) tCGTCATGCTGAGATTAACCTTCTTTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTg < 1:71818/250‑1 (MQ=255) aTGCTGAGATTAACCTTCTTTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTgg > 1:249750/1‑251 (MQ=255) gCTGAGATTAACCTTCTTTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGc < 1:303603/250‑1 (MQ=255) ccTTCTTTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCg > 2:192063/1‑251 (MQ=255) cttcttTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCg > 1:250920/1‑250 (MQ=255) ggACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGGAATCTTCTCCGCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCAGCTTCTTGCTCTCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAGCGCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTGGGTGTGGCTAGGTTTTCCATTCCGGTggg < 2:394107/250‑1 (MQ=255) ggcACTCTCGGAACCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAAc > 1:130802/1‑251 (MQ=255) cACTCTCGGAACCGGGCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATTTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCg > 2:291204/1‑251 (MQ=255) aaCCGGTCTTAACTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGata < 1:103424/251‑1 (MQ=255) tcttcCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCt < 1:269592/223‑1 (MQ=255) tcttcCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCt > 2:269592/1‑223 (MQ=255) cAGTTCTAATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAACACCGGCATGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGTAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAAACGGGCTGGTTATTAATTTGCTGATTGCCGTTTACGGTTTACtg > 2:243146/1‑251 (MQ=255) aGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACtg > 2:246090/1‑250 (MQ=255) tcATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGacc > 1:403871/1‑251 (MQ=255) aTCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGaccgt > 1:109616/1‑251 (MQ=255) ggTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGaccgtcac > 1:76305/1‑251 (MQ=255) aaTCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGaccgtcaccgt > 1:411366/1‑251 (MQ=255) aTCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGaccgtcaccgtc > 1:334209/1‑251 (MQ=255) cctcGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCtttttt < 2:403871/250‑1 (MQ=255) ggTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTCCTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGcct > 2:277033/1‑249 (MQ=255) ggTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCAt < 2:107020/251‑1 (MQ=255) aTTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTc > 2:129842/1‑251 (MQ=255) gTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCg < 1:209893/251‑1 (MQ=255) gcAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGt < 2:112114/251‑1 (MQ=255) aaaaaCCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTg > 2:414105/1‑173 (MQ=255) aaaaaCCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTc < 2:80917/251‑1 (MQ=255) aaaaaCCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCGGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTg < 1:414105/173‑1 (MQ=255) aaaCCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCg > 1:223270/1‑251 (MQ=255) cGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCt > 2:104768/1‑250 (MQ=255) cTGACCACTCCTCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTACTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTCATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGCCGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCgc > 2:161678/1‑251 (MQ=255) aacttcttGCTCGATGCTCGATTAGTGTTAAAGGCTCATAGCTGCCTTCCCCGCTACTGGGCGAAACTCCGGACGGCTGGGTTGCCGTCGGCGTGGCCATGTTTGCCAATCCGGTAGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTACTTTGCTGATTGCCGTTTCCGGATTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTATTTCGGTGATTGCGGTTCCGTCTATCGCCTGCCTggg > 2:408586/3‑250 (MQ=255) tcttGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGc < 2:411366/247‑1 (MQ=255) cTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTc > 2:284217/1‑98 (MQ=255) cTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTc < 1:284217/98‑1 (MQ=255) tctcGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCgtgt < 2:299821/249‑1 (MQ=255) tctcGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATAAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCgtgt < 2:279996/249‑1 (MQ=255) ggTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGt < 1:192063/251‑1 (MQ=255) tgtTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGtt > 1:374101/1‑250 (MQ=255) ggCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGATTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGcct > 2:380791/1‑249 (MQ=255) cTGCCTTCACTGCTACTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCt > 1:149014/1‑251 (MQ=255) aCTGGGCGAAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTaaaa < 1:129842/250‑1 (MQ=255) | GACGTTCGTCATGCTGGGATTAACCTTCTTTTCCGCCAGTATGTGGACCGGCGGCACTCTCGGAACCGGTCTTAGCTATCATGATTTCTTCCTCGCAGTTCTCATCGGTAATCTTCTCCTCGGTATTTACACTTCATTTCTCGGTTACATTGGCGCAAAAACCGGCCTGACCACTCATCTTCTTGCTCGCTTCTCGTTTGGTGTTAAAGGCTCATGGCTGCCTTCACTGCTACTGGGCGGAACTCAGGTTGGCTGGTTTGGCGTCGGTGTGGCGATGTTTGCCATTCCGGTGGGTAAGGCAACCGGGCTGGATATTAATTTGCTGATTGCCGTTTCCGGTTTACTGATGACCGTCACCGTCTTTTTTGGCATTTCGGCGCTGACGGTTCTTTCGGTGATTGCGGTTCCGGCTATCGCCTGCCTGGGCGGTTATTCCGTGTGGCTGGCTGTTAACGGCATGGGCGGCCTGGACGCATTAAAA > NC_000913/354990‑355470 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |