| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,270,455 | 0 | G | T | 29.2% | 69.0 / 11.9 | 48 | noncoding (138/377 nt) | rnpB | RNase P catalytic RNA component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/30); new base T (14/0); total (18/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.34e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGC > NC_000913/3270215‑3270704 | cAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCTATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTTTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTg < 1:225278/251‑1 (MQ=255) gAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACt < 1:265240/250‑1 (MQ=255) aaCTGACCGTTATGCCGGGTTCTGCCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTGCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCGTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGGGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCGCCCTTTCTCCCTTACCTGATCCCGCTTTCGCGGGCCATCGGCTGTTTGCTCTCTGTTGCGCTGGt < 2:387360/251‑1 (MQ=255) cGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTCTTTCCCTGGTctggggg > 2:285122/1‑245 (MQ=255) aTAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCCGTTGGACTGGGCG‑Tggggtt > 1:35282/1‑248 (MQ=255) aaGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTTTTTCTCTTGTCG‑Tggggtttc > 1:103770/1‑246 (MQ=255) ttCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTGTCTCTCTTGCCCCGCGCG‑TGGG‑T‑TTtcccccccgg > 2:379347/1‑248 (MQ=255) tGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGTTCTGGTCG‑TGGGGT‑TTccccccccgggg > 2:338818/1‑246 (MQ=255) tGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTTTTCTCTGTTGCACCGGTCGCGGGG‑T‑TTccccccacgcgg > 1:240478/1‑245 (MQ=255) gTCGGGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCGGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCGATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGc < 2:310398/248‑1 (MQ=255) gACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑Tgg < 1:175246/251‑1 (MQ=255) gTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCAcc < 2:220781/251‑1 (MQ=255) cTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTTTTTTTTCCTTGTCG‑TGGG‑TGTTCCCCCCC‑GGCGTTGCC‑TGGCAccccccccccc > 2:141166/1‑243 (MQ=255) cAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTCTTTTCCTTGTCG‑TGGG‑G‑TTCCCCCCCCCGCGGTACA‑CGGCACCCCGCCCCCT‑GGAGcc > 1:258760/1‑251 (MQ=255) cACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTtc < 1:33545/249‑1 (MQ=255) aCTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGTACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTTCCCCCCCGGCGTTTCC‑CGGCACCCCGCCCTAT‑GGAGCCCCGACTTttctc > 1:301601/1‑251 (MQ=255) ggCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTcctccc < 1:366763/250‑1 (MQ=255) agcagcCTACCCGGGTTCAGGACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGACTTGAGACGGGTGGAGGTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCAACCTTTCACCCTTGCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCAACCTGCACTAT‑GGAGCACGGACTTTCCTCCCCTCCGcc < 2:178714/251‑1 (MQ=255) cagcCTGCCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGAGCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCTCCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCg < 1:247765/251‑1 (MQ=255) cagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCg < 1:172626/251‑1 (MQ=255) cagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGGCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCCGGCGTTACC‑TGGCACCCCCCCCTCT‑GGGGCCCCGGCTTTcctcccccccccccc > 1:253792/1‑243 (MQ=255) aCCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCGCCGCCCGTCTcc < 2:253792/250‑1 (MQ=255) cccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTcccc < 2:393763/251‑1 (MQ=255) cAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCGTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCGGCCCTAT‑GGAGCCCTGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCGCCTCCGAAGAgg < 2:240478/251‑1 (MQ=255) cGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCCCTGGTCG‑TGGG‑G‑TTCCCCCCCCGGCGTTACC‑TTGCACCCCGCCCCATTGGAGCCCG‑CCTTTCCTCCCCCCCCCCCCTCTCCCCCGAAAAGGacgaagacg > 1:287540/1‑250 (MQ=255) ccTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑GGGG‑T‑TTTCCCCCCCGGCGTTACC‑TGGCACCCTCCCCCAT‑GGAGCCCCGGCTTTCCTCCCCTCCCCCCCACTCCCCCgcaaagggagcagaacaaacg > 1:295679/1‑231 (MQ=255) acccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCACCGGTCC‑TGGGGT‑TCCCCCCCCCGCCGTT‑CC‑CGGGACCCCGCCCTCT‑GGAGCCCGGACCTTCCTCCCCTCCCCCCCGCTCCCCCCCAGAGGACGCCCACGaatacgcgacagtc > 2:102197/2‑239 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGAc < 1:309086/193‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctct < 1:135036/122‑1 (MQ=255) gAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTTCACTGGTCT‑TGGGGT‑TTCCCCCCC‑GGCGTTACC‑TCGCACCCCCCCCCCT‑GGAGCCCCGCCTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGCCTGTCT‑gggccgctcctgcgcgccgctt > 1:12124/1‑229 (MQ=255) ccGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGttt < 2:241990/251‑1 (MQ=255) aCTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTAACTGGTCG‑TGGG‑TGTTCCCCCCC‑GCCGTTACC‑TGGCCCCCTGCCCCCT‑TGAGCCCGGGCTTTCCTCCCCTCCCCCCCTCTCCCCCGAAGAGGACGACCACGAAGCGGGGGCCGCCT‑TGGCAGCTTCGGCCGGCAGTATAGAGGGTTTgcggccccctg > 1:29690/1‑243 (MQ=255) tACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCg < 1:127390/250‑1 (MQ=255) aCCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCACTTTTGCACTTGTCG‑TGGG‑G‑TTTCCCCCCAGGGGGTAAC‑CGGGAACCTTCCCCAC‑GGAGACCGGACTTTTCTCCCCTCCGCCCGGCCCCCCCCAAGAGGACGACGAAGAAGCGGGGACTGTCTTGGGC‑GCTTTCGCGCGGAGGATAGAGGGGTTGGGCGGCCTTGTCACCCCCCGGTGCGCAGTCCAATCGcc > 1:184508/1‑251 (MQ=255) gCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAgt < 1:223547/251‑1 (MQ=255) ccTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTcg < 1:229882/251‑1 (MQ=255) cccccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCgcggcg < 2:301601/249‑1 (MQ=255) cccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGat < 1:207703/251‑1 (MQ=255) ccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTCTGTTGCACCTGTCGGTGGG‑T‑T‑CCCCCCCCGGCGTTACCCTGG‑ACCCCGCCCCAT‑GGAGCCCGGGCTTTTCTCCCCCCCCCCCGGCTCCCCCCAAGAGGACGACGACGAAGCCGCGACTGTCT‑GGGCAGCGTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCCTTTCCCCCCCCGGTTCGCAGTCCAATCTCCAGTGTTGCGGCGat > 1:110379/1‑250 (MQ=255) ccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGata < 2:112553/251‑1 (MQ=255) gcgcGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCa < 1:338818/250‑1 (MQ=255) gcgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGat < 2:183243/251‑1 (MQ=255) cggcggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCAGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATa < 2:287540/251‑1 (MQ=255) ggcggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATaa < 1:41119/251‑1 (MQ=255) ggTTTGCTCTCTGTTGCGCTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACGTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTTTCATAAGcc < 2:59056/251‑1 (MQ=255) gTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGccc < 1:285122/251‑1 (MQ=255) ttGCTCTCTGTTGCCCTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCGGCCGTAT‑GGAGCCCGGCCTTTCCTCCCCGCCGGCCGTCTCCCCCTAAGAGGTCGACGACGAAGCGGCGACTGTCG‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACTCCGCGTTGCGCAGTCCAAGCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCTCGGGAGATATTGTCATAAGcccc < 2:375210/250‑1 (MQ=255) tGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCcgc > 1:123492/1‑251 (MQ=255) | CAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCG‑TGGG‑T‑TTCCCCCCCAGGCGTTACC‑TGGCACCCTGCCCTAT‑GGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCT‑GGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGC > NC_000913/3270215‑3270704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |