| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,436,956 | 2 bp→TT | coding (202‑203/741 nt) | cysQ → | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,436,956 | 0 | C | T | 100.0% | 128.6 / NA | 36 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (21/15); total (21/15) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,436,957 | 0 | C | T | 100.0% | 122.2 / NA | 36 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (21/15); total (21/15) | |||||||||||
AAACAATAAGTTAACACCGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTCCCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGGTGTGCGCAAGCAGATTCAGGTCCGCGA > NC_000913/4436714‑4437191 || aaaCAATAAGTTAACACCGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTgg > 2:109626/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |