| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,220,316 | C→T | intergenic (+1115/+1989) | ymgF → / ← ymgD | inner membrane protein YmgF/PF16456 family protein YmgD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,220,316 | 0 | C | T | 100.0% | 44.2 / NA | 14 | intergenic (+1115/+1989) | ymgF/ymgD | inner membrane protein YmgF/PF16456 family protein YmgD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (7/7); total (7/7) | |||||||||||
AAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAACGAACATTGTTACCTCTGGGGAAAATGCAGTAGGTGTTCTTGCATGTTCAAGTCCTGGAGAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGCTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACAACAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAATGGTGGAGAGTTATTTTTTTCCAATGTCACCGCGGTATCAAAACAAGATAAAGGAATATCAATTGATGCATCAAATATCGATTCTCAAGC > NC_000913/1220079‑1220562 | aaaaGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAACGAACATTGTTACCTCTGGGGAAAATGCAGTAGGTGTTCTTGCATGTTCAAGTCCTGGAGAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGaaaaaa < 1:235600/251‑1 (MQ=255) cGAACATTGTTACCTCTGGGGAAAATGCAGTAGGTGTTCTTGCATGTTCAAGTCCTGGAGAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCt > 1:110271/1‑251 (MQ=255) ccTCTGGGGAAAATGCAGTAGGTGTTCTTGCATGTTCAAGTCCTGGAGAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTAAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTAt < 1:49870/251‑1 (MQ=255) aaTGCAGTAGGTGTTCTTGCATGTTCAAGTCCTGGAGAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTAt > 1:196332/1‑251 (MQ=255) ttCTTGCATGTTCAAGTCCTGGAGAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAAc > 1:25853/1‑251 (MQ=255) aGTCCTGGAGAGTCTCTAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGTTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATTTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATaaaaca < 1:153795/251‑3 (MQ=255) agagTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTa < 2:110271/251‑1 (MQ=255) gTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATAGTAATTTAGATTATGTGGCTCTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTa < 1:247784/251‑1 (MQ=255) tCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACATCAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAAtg < 1:89004/250‑1 (MQ=255) aGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACAACAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAATGGTGGAGAGTTATTTTTTTCCa < 2:123001/250‑1 (MQ=255) aTTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACAACAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAATGGTGGAGAGTTATTTTTTTCCAATGTCACcgcg > 1:202133/1‑251 (MQ=255) aaaaTGAATGGTGGGTCCATAACAACTAATGGCATTACTAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACAACAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAATGGTGGAGAGTTATTTTTTTCCAATGTCACCGCGGTATc > 2:108514/1‑251 (MQ=255) acTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACAACAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAATGGTGGAGAGTTATTTTTTTCCAATGTCACCGCGGTATCAAAACAAGATAAAGGAATATCAAt > 1:1516/1‑251 (MQ=255) tATGTTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACAACAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAATGGTGGAGAGTTATTTTTTTCCAATGTCACCGCGGTATCAAAACAAGATAAAGGAATATCAATTGATGCATCAAATATCGATTCTCAAGc > 1:15733/1‑251 (MQ=255) | AAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAACGAACATTGTTACCTCTGGGGAAAATGCAGTAGGTGTTCTTGCATGTTCAAGTCCTGGAGAGTCTCGAACATGTGTCGATGCTGTAGATGATGAAGTTAGTGATTCTAACAGTTACGAAGTTATTAGCCGTGCTGATTTAAAAATGAATGGTGGTTCCATAACAACTAATGGCATTAATAGCTATGGTGCTTATGCTAATGGGAAAAAAGCATATATTAATTTAGATTATGTGGCACTTGAAACTGTGGCTGATGGAAGTTATGCAGTTGCTATTCGACAAGGTAACATTGATATAAAAAATAGTTCTATTACAACAACAGGCACTAAAGCCCCCATTGCAAAAATATACAATGGTGGAGAGTTATTTTTTTCCAATGTCACCGCGGTATCAAAACAAGATAAAGGAATATCAATTGATGCATCAAATATCGATTCTCAAGC > NC_000913/1220079‑1220562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |