| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,545,555 | IS5 (–) +4 bp | coding (157‑160/957 nt) | yddK ← | leucine‑rich repeat domain‑containing protein YddK |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1545555 = | 0 (0.000) | 18 (0.720) | 18/492 | 0.5 | 100% | coding (160/957 nt) | yddK | leucine‑rich repeat domain‑containing protein YddK |
| ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1545558 | 0 (0.000) | 16 (0.640) | 16/492 | 0.6 | 100% | coding (157/957 nt) | yddK | leucine‑rich repeat domain‑containing protein YddK |
| ? | NC_000913 | 2101749 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
TAGCTTTACGAGTCTATCGTAGTTGGTTGCATCAAAATGTGTGAATTGGTTATTATCAAGATTGATAGATGTGAAGTTTTGCAGCCCTGGTGGTTGAGTGGTTAAATTAAGTCCTGATAAATCAATGGTCACTTCATTAGTGTCATCAATTATATTTCTTACTGCAGTCCAGTACTGCATTTGTGCAAGTGGATCATTGTTGATGCCGTTAACTAATACATGCCAAAGATGTTTTGATGATATTAGTTGATCAATGTCATTGGTTGGCAGTAAATTGTTATTGCTTAAGTTTAAATATTCCAGTTTTGTAGTGTTTTTGGCGTTTAAATGTGCAATATGGTTGTCGTTTAAAGTGATTGTTTTCATCCTGGGATGATTGTGTAATATAAGGTCAGTGATCATATTGTGATGGGCACTTAACTCAATCAGAGATTCTTGCCGCGCGAGCCGTTGGCTTCATCGTTATAGCCTTTAAAATCATAT > NC_000913/1545313‑1545795 | tAGCTTTACGAGTCTATCGTAGTTGGTTGCATCAAAATGTGTGAATTGGTTATTATCAAGATTGATAGATGTGAAGTTTTGCAGCCCTGGTGGTTGAGTGGTTAAATTAAGTCCTGATAAATCAATGGTCACTTCATTAGTGTCATCAATTATATTTCTTACTGCAGTCCAGTACTGCATTTGTGCAAGTGGATCATTGTTGATGCCGTTAACTAATACATGCCAAAGATGTTTTGATGATATTAGgga < 2:83532‑M1/249‑4 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |