| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 537,024 | C→T | P147S (CCG→TCG) | glxR → | tartronate semialdehyde reductase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 537,024 | 0 | C | T | 100.0% | 44.9 / NA | 17 | P147S (CCG→TCG) | glxR | tartronate semialdehyde reductase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (11/6); total (11/6) | |||||||||||
CCTCAGGTTGAAGAAGTTCTGTTCGGTGAAAATGGTTGTACCAAAGCCTCGCTGAAGGGCAAAACCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAACCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTCAAAAGCCGGTGCGGACCCGGTACGTGTGCGCCAGGCGCTGATGGGCGGCTTTGCTTCCTCACGTATTCTGGAAGTTCATGG > NC_000913/536784‑537238 | ccTCAGGTTGAAGAAGTTCTGTTCGGTGAAAATGGTTGTACCAAAGCCTCGCTGAAGGGCAAAACCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTg > 1:335667/1‑250 (MQ=255) aagaagTTCTGTTCGGTGAAAATGGTTGTACCAAAGCCTCGCTGAAGGGCACAACCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTACGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGCACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAAc > 1:194225/1‑243 (MQ=255) tACCAAAGCCTCGCTGAAGGGCAAAACCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCTCGATTGAAACTCAGCGTTTCGCTCGACAGGTGAATAAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCAACAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGGTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACAGCTCGGTAAAAATATCACCCACGAGGGCGGTAACg > 1:56631/1‑251 (MQ=255) ccAAAGCCTCGCTGAAGGGCAAAACCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGTTAACGGc < 1:97105/251‑1 (MQ=255) aaCCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGCTTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTACATCACTGTTTGACCTGATCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTgg > 1:154742/1‑251 (MQ=255) gttgATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCAAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGCGCCGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATc > 1:339328/1‑250 (MQ=255) aaaCTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGCGCGGCGATTATCTAGATGCGCCGGTATCCGGCGGTGACATCGGAGGGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGGATTTGAACGTGTTACATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGTGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCACATCAGATTATCATGGCGCTCAATATTGAAGCg > 1:315712/1‑251 (MQ=255) gcgATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGGCGATTATGGTTGGCGGAGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCAACCTCGTGGGGGGCAACGGCGGTGGTc > 1:352348/1‑162 (MQ=255) gcgATTAGCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTc < 1:286578/238‑1 (MQ=255) ccAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGAGATGAAGCGGTATTTGAAAGTGTTAAATCGCTGTTTGTACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGGTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTAAAAAGCCTGTGCGGGCCCGGTACGTGTgcg > 1:262058/1‑251 (MQ=255) gTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTNNTCGGTanna > 2:20644/1‑99 (MQ=255) ggTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGCTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTCAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCCGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTCAAAAGCCGGTGCGGACCCGGTACGTGTGCGCCAGGCGCTGATGGGCGGCtt > 1:300033/1‑251 (MQ=255) 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gTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTTGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCGGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTc < 1:315868/170‑1 (MQ=255) gTTGGCGGTGATGAAGCGGGATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCGCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCTTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTCAAAAGCCGGTGCGGACCCGGTACTTGTGCGCGAGGCGCTGAGGTTCGGCTTTGCTTCCTCACGTATTCTGGAAGTTCATgg < 1:234342/251‑1 (MQ=255) | CCTCAGGTTGAAGAAGTTCTGTTCGGTGAAAATGGTTGTACCAAAGCCTCGCTGAAGGGCAAAACCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAACCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTCAAAAGCCGGTGCGGACCCGGTACGTGTGCGCCAGGCGCTGATGGGCGGCTTTGCTTCCTCACGTATTCTGGAAGTTCATGG > NC_000913/536784‑537238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |