| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,261,296 | C→T | S233L (TCG→TTG) | yjbM → | DUF2713 domain‑containing protein YjbM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,261,296 | 0 | C | T | 100.0% | 44.1 / NA | 17 | S233L (TCG→TTG) | yjbM | DUF2713 domain‑containing protein YjbM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (8/9); total (8/9) | |||||||||||
CTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATCTGGTGAATGAAGGAACGCTCGATCCTGATATTTTAAGCAAAATGCGAGATGCTGCACCACAATTAATTAGCTTCGCGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGA > NC_000913/4261079‑4261533 | cTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCAAATCTGGTGAATGAAGGAACGCTCGATCCTGATATTTTAAGCAAAATGCGAGATGCTGCACCACAATTAATTAGCTTCGCGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTAt > 1:202125/1‑251 (MQ=255) cgagccTGATATTTTAAGCAAAATGCGAGATGCTGCACCACAATTAATTAGCTTCGCGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAGAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGat > 1:117006/5‑250 (MQ=255) ttAAGCAAAATGCGAGATGCTGCACCACAATTAAGTAGCGTCGCGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTGCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTAGATAAAAGGACCCAATATTTATTGTGTTCTTTTGTCTCTATCAACACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGt < 1:136594/250‑1 (MQ=255) ngagaTGCTGCACCACAATTAATTAGCTTCGCGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCaa > 1:67547/2‑178 (MQ=255) cTTCGCGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTTCAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTg > 1:325969/1‑251 (MQ=255) cgAAGTCGTTTGACACAACCTCAAAGGAAGAGATTCAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTAt > 1:99668/1‑251 (MQ=255) cGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTgg < 1:148054/251‑1 (MQ=255) cccAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCGATCAATACTATTAGCAGGGAGATATTTCACCAGAGTTTAATGTTTGATTTTGTATTTAtcg < 1:289381/219‑1 (MQ=255) ncTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTAtcgtc > 1:87873/2‑216 (MQ=255) ccTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAAGTTATGATTTGGTCTGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGGATGGAAGGCATTATAGAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCGGTTGTCTCTATCAATACTAGGAGCAGGTAGATAGATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTGGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGt < 1:142724/251‑1 (MQ=255) tCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGTAGAAATAAGATGTGAATTTCTTCGATAGTa < 1:100409/100‑1 (MQ=255) aaaGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCATAGTTTAATGTGGGATTTTTTATTTATCGTCTACCCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAAc < 1:182427/251‑1 (MQ=255) gaTTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAACTTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGc > 1:181407/1‑155 (MQ=255) aattaattTATGATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTATATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTGTTTCCATCACTTCGTGagagn < 1:88075/251‑2 (MQ=255) gATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGAccn < 1:214250/77‑2 (MQ=255) gATTTGTTCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGAccc > 2:214250/1‑77 (MQ=255) tCGGGGTTAAATTGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCAGGCCTTGAGAGGa < 1:57419/250‑1 (MQ=255) | CTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATCTGGTGAATGAAGGAACGCTCGATCCTGATATTTTAAGCAAAATGCGAGATGCTGCACCACAATTAATTAGCTTCGCGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGA > NC_000913/4261079‑4261533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |