| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,511,466 | C→T | V293V (GTG→GTA) | yhfZ ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhfZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,511,466 | 0 | C | T | 100.0% | 41.8 / NA | 16 | V293V (GTG→GTA) | yhfZ | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhfZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (10/6); total (10/6) | |||||||||||
GTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGTTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCGACTCGCGTCAGGACCACGGCTTCGGTGGCCTGTAAAAATCGCGGATCGTCTGTGAGCGGCGTCGCCTCTAATCCCAGCATGGTCAGTTCGTTTTCCGCCACCACGTTCCAGATCACCGCATCGACATCGCCTTTAACAATGCGTTGTAAACTCTCGTGATAAG > NC_000913/3511222‑3511707 | gTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGAGCATCAGTGCACTCGCAATATGTGTCCTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGTTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATCTCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCACCACTTACTAcc > 1:176232/1‑251 (MQ=255) aGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGAACTCGCCATATGTGTAATCGCCATCGTTTCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGCTGGCACTCTGATTCCAGTCCGTTGACGGCCTGCATCATGCCTTTGCAAATGTCCTCATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCCTATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCgttgt > 1:345566/1‑250 (MQ=255) caccacGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGTTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCGTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCGCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTTCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAgggn < 1:42913/251‑2 (MQ=255) gACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTCAGCACCGGCAGATGGCACTATGTTTCCAGTCCGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATACCGCCTGCCTCGAAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTCCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATc > 1:50742/1‑251 (MQ=255) ccAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGAAAAGAAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTCTCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTggg > 1:132945/1‑201 (MQ=255) gTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCAc < 1:22199/174‑1 (MQ=255) aatatcgccttctgcGCAAAGCGGGTTGAGTCGGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGGTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCGGCTTTCTACCGGTTTTGGATGGGCGATCAGGGCG‑GTATTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCGACTcgcg < 1:164827/157‑1 (MQ=255) cGCCTNNCTNNNAANNCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATNAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCNGNTNCCCANNTACNACCCGTTGTTNATGGGCGAGCAGGGCGTGt‑t > 2:256053/1‑115 (MQ=255) cGCCTGCCTCGCTAAGCAGGGTGAGTCTGTTTTCCATATCAGATTCCTTTCGTCTAATAACTCGTTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGt‑t < 1:256053/115‑1 (MQ=255) ctCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCGACTCGCGTCAGGACCACGGCTTCGGTGGCCTGTAAAAATCGCGGATCGTCTGTGAGCGGCGTCGCCTCTAATCCCAGCATGGTCAGTTCGTTTTCCGcc > 1:165441/1‑251 (MQ=255) gCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGATGTTGATGGCCGAGCAGGGCGTGT‑TTATATACAACGGCACGCAGCCGTTGTTGCATTGGGTAATCTTTGACTCGCGTCAGGCCCACGGCTTCGGTGGCCTGTAACAATCGCGGATCGTCTGTGAg > 1:345675/1‑205 (MQ=255) aaaGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCGACTCGCGTCAGGACCACGGCTTCGGTGGCCTGTaaaaa > 1:125962/1‑185 (MQ=255) ggTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCAGCGACTCGCGTCAGGACCACGGCTTCGGTGGCCTGTAAAAATCGCGGATCGTCTGTGAGCTGCGGCGCCTCTAATCCCAGCTTGGGCAGTGCGTGTTCCGCCACCACGTTCCa < 1:296120/251‑1 (MQ=255) gTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTTCAGTGGTTAATCATCGACTCGCGTCAgn < 1:85971/147‑2 (MQ=255) gTTCCTGTTCCCCACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCGACTCGCGTCAGGACCACGGCTTCGGTGGCCTGTAAAAATCGCGGATCGTCTGTGAGCGGCGTCGCCTCTAATCCCAGCATGGTCAGTTCGTTTTCCGCCACCACGTTCCAGATCACCGCATCGACATCGCCTTTAACAATGCGTTGTAAACTCTCg > 1:11524/1‑251 (MQ=255) cccACTTACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCGACTCGCGTCAGGACCACGGCTTCGGTGGCCTGTAAAAATCGCGGATCGTCTGTGAGCGGCGTCGCCTCTAATCCCAGCATGGTCAGTTCGTTTTCCGCCACCACGTTCCAGATCACCGCATCGACATCGCCTTTAACAATGCGTTGTAAACTCTCGTGATAag > 1:128709/1‑248 (MQ=255) | GTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGTTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGT‑TTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATCGACTCGCGTCAGGACCACGGCTTCGGTGGCCTGTAAAAATCGCGGATCGTCTGTGAGCGGCGTCGCCTCTAATCCCAGCATGGTCAGTTCGTTTTCCGCCACCACGTTCCAGATCACCGCATCGACATCGCCTTTAACAATGCGTTGTAAACTCTCGTGATAAG > NC_000913/3511222‑3511707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |