| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,498,392 | A→C | intergenic (‑97/‑279) | alaC ← / → pyrS | glutamate‑‑pyruvate aminotransferase AlaC/sensor histidine kinase PyrS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,498,392 | 0 | A | C | 100.0% | 44.2 / NA | 15 | intergenic (‑97/‑279) | alaC/pyrS | glutamate‑‑pyruvate aminotransferase AlaC/sensor histidine kinase PyrS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (6/9); total (6/9) | |||||||||||
CGGGTTACCCATGCTGAAATCGATAATATCTTCGCCGCGCCGACGCGCAGCCATTTTCAGTTCAGCGGTGATGTTAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAG > NC_000913/2498158‑2498622 | cGGGTTACCCATGCTGAAATCGATAATCTCTTCGCCGCGCCGACGCGCAGCCATTTTCATTGCAGCGGTGATGTTAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTTAGCCATAATTTCCTAAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACAttn < 1:220340/251‑2 (MQ=255) tttCAGTTCAGCGGTGATGTTAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTgc < 1:93593/250‑1 (MQ=255) gggCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCATCAGATTCACGTTAGCGCCCGGAACGTCCGAGTGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTttatt > 1:238289/1‑250 (MQ=255) ngggAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAAc > 1:104371/2‑250 (MQ=255) cGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTACTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTaa > 1:171629/1‑242 (MQ=255) cgTAAAGTTACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCAATAATTTCCTGAGATTAACGTTTGGGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGTGGGTGTCTTTGTTGAAAATAGCCTAATGAATTTCTTGCTGTCCCTCGTTTTAGAACATTTTATTAATTACGTTAATTGACGAACGCTGCTTTAAAATCAGCAAAGTTATCTTCGCGAACAAGAAAGTTACCACTAATTTTATTAGCATAATAAGTGCAATAAAtt < 1:197248/251‑1 (MQ=255) nccATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAag > 1:36665/2‑248 (MQ=255) tAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGGGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACAcc < 1:97630/250‑1 (MQ=255) gACGCTGCCACGATTGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTTCTTATGCACGATTTATCTATCAAGCCCCTTTTAAAAtt < 1:124293/251‑1 (MQ=255) tGCCANGATGGNGNNTGTTTTGAAACTAGCCTGANTAATTTCTGTCTGTCNCGAGNTTTAGNACNtn > 2:139016/1‑66 (MQ=255) tggtggCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATGAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTAcc < 1:46385/131‑1 (MQ=255) tGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAAGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGaa > 1:194844/1‑112 (MQ=255) aaTAGCCTGAGTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACTTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTAGCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACGCATTTTAGTAACATAATAATGTCAATAAATTTGCTAACCATAAGTGCATTATCAAGAGATTCATTGCTAATACACCGTTTATCGATCAATCCCCTTTTAAAATTGTTGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTgg < 1:336470/251‑1 (MQ=255) gATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACGCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTAGCAAGAGATGCATTGCTAATGCACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAAGTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAg < 1:200810/250‑1 (MQ=255) gtcCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTNc < 1:275970/209‑1 (MQ=255) | CGGGTTACCCATGCTGAAATCGATAATATCTTCGCCGCGCCGACGCGCAGCCATTTTCAGTTCAGCGGTGATGTTAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAG > NC_000913/2498158‑2498622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |