| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,111,867 | G→A | W335* (TGG→TGA) | opgH → | osmoregulated periplasmic glucans biosynthesis protein H |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,111,867 | 0 | G | A | 100.0% | 42.6 / NA | 15 | W335* (TGG→TGA) | opgH | osmoregulated periplasmic glucans biosynthesis protein H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (7/8); total (7/8) | |||||||||||
CCACCGGGAATGCCAAACACTTTGATGTCTACATTCTTAGTGACAGTTATAACCCGGATATCTGCGTCGCAGAGCAAAAAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTG > NC_000913/1111674‑1112059 | ccACCGGGAATGCCAAACACTTTGATGTCTACATTCTTAGTGACAGTTATAACTTGGATATCTGCGTCGCAGAGCAAAAAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGACGGTACGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCAAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGAt > 1:284831/1‑251 (MQ=255) aCATTCTTAGTGACAGTTATAACTTGGATATCTGCGTCGCAGAGCAAAAAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATgg < 1:389842/249‑1 (MQ=255) cGTCGCAGAGCAAAAAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTTTGCGGGCTGGTGCGCCTGAGGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGc < 1:425058/251‑1 (MQ=255) tCGCAGAGCAAAAAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCg > 1:401947/1‑251 (MQ=255) gatggaGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGCCTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGTTGCTGGATGCGGACTCGGTAATGACCGGTGGTTGTGTGGGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGTATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATa < 1:224263/251‑1 (MQ=255) ggTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGc < 1:197689/122‑1 (MQ=255) gCGAAAGTCGGATTTGCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGGTGA‑GCGTAAAAGCGGTAATATCGATGAGTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCATTACAGCTACATGTGGGTTCTGTATGCTTATTCGGTAATGACCGTTGATTGTGTGTCCTGGCGGGTTCGCGTTATGTAAGTCAACCCGATTGTCGGGAGCATGCAGTCGTTGCCGAAAGCGGCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTc < 1:382915/251‑1 (MQ=255) gAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGCCCGGTGAttgtttg > 1:210598/1‑144 (MQ=255) aGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATGGTTtgtg < 1:396668/144‑1 (MQ=255) agcgccgccgcCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGGGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATggn < 1:122026/249‑2 (MQ=255) nccgccgTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATggtggt > 1:124568/2‑85 (MQ=255) gccgccgTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTg > 1:249458/1‑251 (MQ=255) ccgcG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGTATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATgcg < 1:72014/202‑1 (MQ=255) ccgcG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTcc > 1:199785/1‑181 (MQ=255) cGATGACTTCTGCCGTCGCTGAGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGc > 1:66590/1‑111 (MQ=255) nggnCAGCCNGTACNGCTACATGGTGGTGCNGGATGCTGACTCGGTAATGNNCNGTGAtnggttg < 2:210598/64‑1 (MQ=255) | CCACCGGGAATGCCAAACACTTTGATGTCTACATTCTTAGTGACAGTTATAACCCGGATATCTGCGTCGCAGAGCAAAAAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCG‑TGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTG > NC_000913/1111674‑1112059 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |