| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 968,837 | G→A | D158N (GAT→AAT) | lpxK → | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 968,837 | 0 | G | A | 100.0% | 40.5 / NA | 16 | D158N (GAT→AAT) | lpxK | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (9/7); total (9/7) | |||||||||||
GTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGC > NC_000913/968609‑969066 | gTATCGCGGGGATATGGTGTTAAGGCTGAATCTTAGCCGCTGTTATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTGGCGGTTTCGCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAATAGCCATTCTGGCGCAACACCCCGATGTGCAGAGCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCAGTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGa < 1:218496/251‑1 (MQ=255) nttATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTTAATCGCCTGTTGCGGTTTTTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAAAACCCTGATGTGCCGATCATCGTAACCGACGACGGCTTACAGCATTACCCTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTTTTTGTGGGGTGCGGTGCTTTGGCAATgagatcggaagaaaacccg > 1:303626/2‑233 (MQ=255) aGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGNg < 1:395594/251‑1 (MQ=255) tgaACNNGTNNNGANNTATCAACGCACTGATGCGCCTGTNGCGGTTTCTCCCGTTAGTTCTGCTGAGGTNANANCCATNNTGGNGCAACACCCTNATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGNGNGTACTGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTNCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGCGGNTGccnnggng > 2:380019/1‑207 (MQ=255) cACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGCAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGGGGGgc > 1:396882/1‑212 (MQ=255) gATGCGCCTGTTGCGGATTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCACCACCCTGATGTGCCGCTCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGcccctg > 1:413781/1‑188 (MQ=255) gCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGCTGNTGTNNNNNGcnnnnnn > 2:315848/1‑144 (MQ=255) ctcCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAAACGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGGGGGGCGGTTAAAGTCGGTTGATGGGGTAATCGGCAACGGCGGTGGcccccgacggggtggaatcccc > 1:64978/1‑232 (MQ=255) cccGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATccn < 1:315848/248‑2 (MQ=255) ngttcTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGGGAAAGCCCCATGCATct > 1:129928/2‑251 (MQ=255) ttcNGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATg < 2:303626/137‑1 (MQ=255) ggTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGGCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATGGATGGTGTGCGTCGCTTTGTCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTgagcgagc < 1:70217/165‑1 (MQ=255) aaaaGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGCTCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGGCCATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGCTGGTGCGGTAATCGTCAACGGCCGTGTCCCTCCCCACGGTGAAATccccccgcctacagcgccgggtccgg > 1:192859/1‑229 (MQ=255) gTAACCGACGACGGATTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATAGCCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGGCCCTCCCAGCGGGGAAATCCCCCCGCCTCTGGCGCCGGGGCAGGCGGGGAAATTTCGTAACGGTTcgcggtggggagttggcc > 1:359721/1‑236 (MQ=255) cAGCATTACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGGTAGTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGGCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCAGCTGCTGCCGGGTCAGGCGGGGAATTTACGTACCGGTGCGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGc < 1:380019/251‑1 (MQ=255) tACCGTCTGGCGCGTAATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGTCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGcc < 1:390391/83‑1 (MQ=255) | GTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGGCAGATACCACAACAGCACAGGCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGCCAATGCGTGAGCGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGC > NC_000913/968609‑969066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |