| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 871,045 | G→A | V27I (GTC→ATC) | gsiC → | glutathione ABC transporter membrane subunit GsiC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 871,045 | 0 | G | A | 100.0% | 47.0 / NA | 19 | V27I (GTC→ATC) | gsiC | glutathione ABC transporter membrane subunit GsiC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (7/12); total (7/12) | |||||||||||
CCGCTGGTGGTAGAAAAACTGGTGTCGGCACACAGTAAAAACCTGACCGGTTTTTGGATCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTGTCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATG > NC_000913/870845‑871209 | ccGCTGGTGGTAGAAAAACTGGTGTCGGCACCCAGTAAACACCTGACCGGTTTTTGGATCCTGCCAGCCACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGCGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGGGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCt > 1:326373/1‑251 (MQ=255) ntggtAGAAAAACTGGTGTCGGCACACAGTAAAAACCTGACCGGTTTTTGGATCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCgattg > 1:56895/2‑227 (MQ=255) tAAAAACCTGACCGGTTTTTGGATCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCTATCCGGGGCTATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATgcg < 1:421902/222‑1 (MQ=255) gACCGGTGTTTGGATCATGCCAGACATCGGCTTGAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAAGAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCATACTGGGGTTGATTCCGACTCTTTTTAGCGGCTCGGTGCTGGTGTTGTTAGTTATCCATATGCCGCCCCGCGATGCGGCTGGATTGATTGGCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTATAGAACTGGGGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGa < 1:508561/251‑1 (MQ=255) cacCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCCATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAACCGCTTAATGGGGTTGATTCCGACGCTTTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCCGGTTATAg > 1:383795/1‑199 (MQ=255) ctgtGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAGCGCGGACTTGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGccc < 1:287208/132‑1 (MQ=255) cgcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTANTTACGTTATCNAACNNTTACNGNGNTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTNCTGGTGTTTTTATTTATCCATATNNTGNNNGGNNATCCg < 2:381112/135‑1 (MQ=255) cgcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATACTGCCCGGCGCTCCg > 1:381112/1‑135 (MQ=255) aaCGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATGTATCCATATGCTGCCCGGCTATCCGgcgc < 1:403593/121‑1 (MQ=255) cAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCg < 1:207856/251‑1 (MQ=255) ggAGTGGAATGATTAATTACGTTCTAAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGAGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATGCGGCGCGAATGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGCTATAGAACTGGTGCGTCAGCAACTGGGGTTg > 1:390816/1‑179 (MQ=255) aTGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTNCTGGGGNNGANTCCGACGCTGTTTATCGTCNCGNNNCNNNTNTTTTTNTTNNTCCATATGCNGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTANAGAACTGGTNNGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCNGCCNNTNNANCAcn > 2:111545/1‑189 (MQ=255) aTGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTgg < 1:111545/198‑1 (MQ=255) gCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCNGACGCTTTTNNTCNTCTCGNTNNNGNNNTTNTTATTTATCCATATGCTGCNCGNNGATCCGNCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCt < 2:110574/127‑1 (MQ=255) gCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCt > 1:110574/1‑127 (MQ=255) cGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGCCGCTGTTTATCGGCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCGGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGc < 1:277283/117‑1 (MQ=255) aaCGCTTACTGGGGTTTATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGattgattgn < 1:49020/97‑2 (MQ=255) ggggTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATg > 1:448802/1‑214 (MQ=255) gATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTTCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTATAGAACTGGTGCGTCATCAGCTGGGGGTGGATCAGCCGCTGTa < 1:422617/150‑1 (MQ=255) tCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTATCCATATGCTGCCCgn < 1:406172/43‑2 (MQ=255) | CCGCTGGTGGTAGAAAAACTGGTGTCGGCACACAGTAAAAACCTGACCGGTTTTTGGATCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTTTTTATTTGTCCATATGCTGCCCGGCGATCCGGCGCGATTGATTGCCGGGCCCGAAGCTGATGCGCAGGTTATAGAACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATG > NC_000913/870845‑871209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |