| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 579,076 | G→A | intergenic (‑183/+108) | borD ← / ← ybcV | prophage lipoprotein BorD/DUF1398 domain‑containing protein YbcV |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 579,076 | 0 | G | A | 100.0% | 47.2 / NA | 17 | intergenic (‑183/+108) | borD/ybcV | prophage lipoprotein BorD/DUF1398 domain‑containing protein YbcV |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (8/9); total (8/9) | |||||||||||
CACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCC > NC_000913/578842‑579319 | nacaTCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAAAAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACCGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGaata > 1:53528/2‑250 (MQ=255) gggCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGcacac > 1:414342/1‑250 (MQ=255) gggCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGAGTTATTCCCGACGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTAATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGcacac > 1:325214/1‑250 (MQ=255) tttttCTTTGTGTTATTCCCGATTCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTTTTGAAAATTAAACAAACCTGAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGGGATGAATCTTCATTGTTTTCCCGGATTATCTTTGTCCTCTGCCCTGACGTAGATCTTCTCTGCGAGATTGTCCTGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTTCAtgtattgta < 1:357756/250‑1 (MQ=255) cATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGAATGTGTAGACAATTAAAGCCACCGTAAACAATGAGCTGCAATTTCCTATTGCTAATATTTATCAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGCTTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGc > 1:284563/1‑251 (MQ=255) aGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAgn < 1:310311/250‑2 (MQ=255) acaaacCCTAAACAATGAGTTGACATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGAATGCCAGGTGAGATGAATCGTCATTGTATTACCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTACAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGcc > 1:211040/1‑194 (MQ=255) aaaCAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCTCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAg < 1:1309/249‑1 (MQ=255) gTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTAAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAAtn < 1:311057/251‑2 (MQ=255) tCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTATCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGt < 1:454017/250‑1 (MQ=255) gTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAgg < 1:139644/250‑1 (MQ=255) cGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATACTTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGtattat > 1:338748/1‑129 (MQ=255) cgtaTTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTcc < 1:209640/49‑1 (MQ=255) cGGATNACCTANGNNAACAGCCCTGACGGGGAACNTCTCTGCGAGAGTGTnc > 2:209640/1‑52 (MQ=255) ncccTGACGGGGAACTTCTCTGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAg > 1:299264/2‑155 (MQ=255) nntctNCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAg < 2:299264/137‑1 (MQ=255) ctGCGAGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTcc < 1:110330/249‑1 (MQ=255) | CACATCCTGTAATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCC > NC_000913/578842‑579319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |