Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 516,955 | C→T | P125S (CCT→TCT) | fetB → | putative iron ABC exporter membrane subunit FetB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 516,955 | 0 | C | T | 100.0% | 32.3 / NA | 14 | P125S (CCT→TCT) | fetB | putative iron ABC exporter membrane subunit FetB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (4/10); total (4/10) |
ATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTA‑TTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATG > NC_000913/516751‑517185 | atTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGTAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGTGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGt < 1:177821/250‑1 (MQ=255) nccAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGGTTGAATTTATCCCCATGCAGGTGGTCTCTATCGCCGGGGTGATTGCCGGTAACGCCCTGGGAGCGGGGGGGTTGTGTTacaac > 1:123810/2‑243 (MQ=255) gCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGGTTCTCTTAGGGTCGGTTGAATTTTTCCCGATTCAGGTGATCTCTATCGCCGGGGTGATTTCCGGGAAAGCCATGGTAGCGGTGGGGGtgtggta > 1:366651/1‑202 (MQ=255) gCNTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAANACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCNCNTCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGNTTCTCTCAGGNTCGNNTGAANTNANCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGGGANGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGNNGTNNNGTNNTGTTa < 2:366651/205‑1 (MQ=255) cTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTTTCTCAGGGTCGATTGAATTTATTCCGATGCAGGGGATCTCTATCTCCGGGATGATTGGCGGGAACGCCATGGGAGCGGTGGGGTTGGGTTTCAACAATTTAGGGCAACGGGGCATTAGCGAAAAACAACCGATTCAGGAGAAACTGAGGTTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGat > 1:38236/1‑250 (MQ=255) gTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTGATCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGGGACGATTGCCTGTAACCCCATGGTAGCGGt < 1:399973/129‑1 (MQ=255) gTTTATTGCCAGTACGGGCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCTATGGAAGTGATCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGGTATGATTGCCGGTAACGCCATTGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAGCAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTTAGGAGAAACTg < 1:72757/196‑1 (MQ=255) ggTGCTGATTCTCACAGAGACGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTGGTGTT‑CAACCATTTTGGGCAAAGGGGCATTAACGAAAAGCAACAGATTCAGGGGAAAATGGGGCTTGGTGGGGCGCCGAAGCAGGGCTCCGCGAAATTGATTAGGCACCGTAATTGGCG‑GGGTTTAATTCCGACGGGCGATTCCGCaaaaaaggg > 1:402402/1‑247 (MQ=255) tgatgcgctcAGGGTCGATGGAATTTATCCCGATGCAGGTGAGATCTATCGCCGGGATGATTTCCGGTAACGCCAGGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTacaac < 1:464310/94‑1 (MQ=255) ctcAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTA‑TTCGCGCGGCTTTAATGCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAg < 1:427127/248‑1 (MQ=255) gTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTA‑TTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGTCTTAGTGAGTTTAc < 1:423320/251‑1 (MQ=255) ttGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCTCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTA‑TTCGCGCGGCTTTAATTcc < 1:169374/205‑1 (MQ=255) nntANNNNNATGNAGGTGATCTCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGcc < 2:302425/144‑1 (MQ=255) aGGTGATCTCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACTCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTGGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTA‑TGCTCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAatgatg < 1:495861/239‑1 (MQ=255) | ATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTTATCTCATCGTTTATTGCCATTACGGTCGGGGCGGGAATTACCCTGGCGGTGCTGATTCTCTCAGGGTCGATTGAATTTATCCCGATGCAGGTGATCCCTATCGCCGGGATGATTGCCGGTAACGCCATGGTAGCGGTGGGGTTGTGTTACAACAATTTAGGGCAACGGGTCATTAGCGAACAGCAACAGATTCAGGAGAAACTGAGTCTTGGTGCGACGCCGAAGCAGGCTTCAGCGATATTGATTCGCGACAGTA‑TTCGCGCGGCTTTAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATG > NC_000913/516751‑517185 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |