| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,143,377 | C→T | S283L (TCA→TTA) | frwC → | putative PTS enzyme IIC component FrwC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,143,377 | 0 | C | T | 100.0% | 43.9 / NA | 17 | S283L (TCA→TTA) | frwC | putative PTS enzyme IIC component FrwC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (6/11); total (6/11) | |||||||||||
CGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGCAAGCTGGGTTATATCGCAGCAGTGGCTGTCGGAGCAGTGGTGACGGCTGTTTGTGTGAACGTGCTGAAAAGTCTGGCGCGTAAAAATGGGTCTTCGACTGATGAAAAAGAAGACGACCTGGATTTGG > NC_000913/4143189‑4143592 | cGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTCAAAATTTCTCCGCAGAAGCGCGCGAAACCGGCAAAGCAGCACTGGAGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGCAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTc > 1:435053/1‑251 (MQ=255) ggATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGACCGCGAAACCGGCAAAGCGGACCTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTACTTTCGCCGCTGCCGATACGCTGCGTGTCATTCCTTCAATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAgg > 1:231880/1‑250 (MQ=255) ggTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGT‑CTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAGTCCGTCCATCATGGTCGGTTTAGGTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGTCGGTGGTTTAAGGCAATCTTGGTTATATCGcagcag < 1:417004/249‑1 (MQ=255) tcCGCNNAANNNCGNNAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGNTGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGNTNCNTTTCNNCGCNGCCGATCAGCNGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACNGNGGCGCTgg > 2:367783/1‑154 (MQ=255) tcCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACGGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTGGCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTgg < 1:367783/154‑1 (MQ=255) cgcgAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTTCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCTGTTTAGTGTGTTGTCCAGTAACTTCTGCGCTGGTGGGTGCGCAGTGCTATGCAGTCTTGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGCAAg < 1:496870/204‑1 (MQ=255) ggCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGCAAGCTGGGTTATATCGCAGCAGTGGCTGTCGGAGCAGTGGTGACGGCTGTTtgtn < 1:89114/247‑2 (MQ=255) gCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGc > 1:293563/1‑141 (MQ=255) ggCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAgn < 1:149918/183‑2 (MQ=255) ggTNATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGANTNCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGNTTTAGTTTGTNGTGNNGTAANTNCNGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGNTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCNNTGNNNGANNGCAAg < 2:368497/181‑1 (MQ=255) ggTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGCAAg > 1:368497/1‑181 (MQ=255) gTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGG‑TGGTCTGATTGtgctg < 1:138595/161‑1 (MQ=255) ggtGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTTCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGTTGGTTGAAGGCAAGCTGGGTTATATCGCAGCAGGGTCTGTCGGAGCAGGGGTGACGGCTGTTTGTGTGAACGTGCTGAAAAGTCTGGCGCGTAAAAATGGGTCTTc < 1:484897/249‑1 (MQ=255) cnatNGCCGANGCCGNTCCGCTGCGTGTCATNCCTTCCATCATGGTCGGTANNGNTTGAGNTGCAg < 2:220965/63‑1 (MQ=255) agccGCTGCGTGTCATTCCTTCCAGCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCGGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGTTTGAAGGCAAGCTGGGGTATATCGCAGCAGTGGCTGTCGGAGCAGTGGGGACGGTTGTTTGTGTGAACTTGCTGAAAAGTCTGGCGCGTAAAAATGGGTCTTCGACtg < 1:294048/223‑1 (MQ=255) tCCGCTGCGTGTCCTTCCTTCCATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCCGTAAATGGGGAACTGGTCGGGGCGCAGTGCTAAGCCGGCTGGGGTGGTCTGGTTGTGCTGCCGGGGGTTGAAGGCAAGCTGGGTTATATCGAAGCAGTGGCTGTCGGAGCAGTGGTGACGGCTGTTTGTGTGAACGTGCTGAAAAGTCTGGCGCGTAAAAATGGGTCTTCGACTGATGAAAAAGAAGACGACCtggatttgg > 1:263978/1‑251 (MQ=255) atgcctgccATCATGGTCGGTTTAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGTCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGTTGGGTGAATGCAAGCTGGGTTATATCGCCGCAGTGGTTGTCGGAGCAGTGGTGACGGCTGTTTGTGGTAACGTGCt < 1:78045/169‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGTTTGTGGTGCATTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAgg < 1:494511/94‑1 (MQ=255) | CGTGGGTATTTGTATCCCGCCGCTGGGGATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTTGGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGCAAGCTGGGTTATATCGCAGCAGTGGCTGTCGGAGCAGTGGTGACGGCTGTTTGTGTGAACGTGCTGAAAAGTCTGGCGCGTAAAAATGGGTCTTCGACTGATGAAAAAGAAGACGACCTGGATTTGG > NC_000913/4143189‑4143592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |