| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 397,530 | G→A | V298I (GTA→ATA) | sbmA → | peptide antibiotic/peptide nucleic acid transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 397,530 | 0 | G | A | 100.0% | 58.7 / NA | 24 | V298I (GTA→ATA) | sbmA | peptide antibiotic/peptide nucleic acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (14/10); total (14/10) | |||||||||||
GGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTGGTAGGGATCAAACTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGGTACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCGGCCTGATGACGCAGATTACCAACGTTTTTGGTCAGGTTCGCGGTGCTTTCCAGTACCTGATTAACTCATGGACCACACTGGTTG > NC_000913/397307‑397770 | ggTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGCGCTGCCGCTTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTGGTAGGGATCAAACTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACgg > 1:442959/1‑250 (MQ=255) caTTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTAGCTGATGGGGACCGGCTTCCTGGCAGTGGTAGGGATAAAACTGACGGGGCAGGAGTTTAACAACCAGCCTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGATGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTCCGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAACAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCg > 1:378760/1‑251 (MQ=255) cGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGGGGTAGGGATCAAACTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACAGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCg > 1:272233/1‑195 (MQ=255) gTCTGGTGATGTCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTGGTAGGGATCAAACTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAGAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATTCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGccc < 1:355174/243‑1 (MQ=255) gATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGAGCGGATTGCTGGCAGTGGTAGGGATGAAGCTGCCGGGGCTGGAGTTGAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTAGCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATATGCGAGCTGTTTAGCGcc < 1:80002/181‑1 (MQ=255) ngCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTGGTAGGGATCAAACTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGt > 1:58712/2‑251 (MQ=255) aGGGATCAAACTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAgc > 1:3083/1‑127 (MQ=255) cTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTc > 1:389648/1‑226 (MQ=255) annaaCCAGNNTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAgc < 2:3083/99‑1 (MQ=255) aGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCGGCCTGATGACGCAGATTAcc < 1:182021/251‑1 (MQ=255) gtAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGCCGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATCCGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGaaaaa > 1:77229/1‑101 (MQ=255) cGTAAAGAGCTGGTTAATGGTGAAGACGATGCCCCGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACAGAAAAACTATTTCCGCCTCGATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATGTGCATGTCGATAACGGTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGcn < 1:62019/195‑2 (MQ=255) ggTTTATGGAGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCAGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCgg > 1:106578/1‑201 (MQ=255) ntgnagangnncnncccngcgcgcCGCCGCCTACGATACNNGAGCTGTTTNGCGCTGTACGAAAAAATTTTTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACNTCGCCCGCANNCTNTATTGNCNNNTNNNTANCGTTTTCGGTTTGTTCTTGNTGNNTCCGTCNATTGTTGCCGGTACGAGTACGCTCgg < 2:106578/175‑1 (MQ=255) gAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTCTATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGACGATCCCGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGGCAATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCGGCCTGATGACGCAGATTACAAACGTTTT‑AGTAAGGTTCGCGGTGCTTTCCAGTACCTGAtt > 1:262465/1‑251 (MQ=255) aCGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTCTTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCGGCCTGATGACGCAGATTACCAACGTTTTTGGTCAGGTTCGCGGTGCTTTCCAGTACCTGATTAAc > 1:207211/1‑251 (MQ=255) gATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCAGACTCTACTTTCACTATATGTATTTCACCATAGCCTGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAAAGTTTTCgg > 1:254622/1‑137 (MQ=255) 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ccgccTACTATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCAGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCGTCCTGATGACGCAGATTACCAACGTTTTTGGTCAGGTTCGCGGTGc > 1:464805/1‑212 (MQ=255) ccgccTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGCACGGAAAACCTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCCATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCGGCCTGATGACGCAGATTACCAACGTTTTTGGTc > 1:335633/1‑199 (MQ=255) cgccTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAATTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGCTGGTACGAGTCCGCTCGGCCTTATTACGCAGATTan < 1:130004/184‑2 (MQ=255) ccTACGATACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCt > 1:31607/1‑128 (MQ=255) | GGTAACGCTCTCCGCGCATGTGCCGGAGCTGCCGATTATCGGGCACATTCCGTATGGTCTGGTGATTGCCGCAATCGTCTGGTCGCTGATGGGGACCGGATTGCTGGCAGTGGTAGGGATCAAACTGCCGGGGCTGGAGTTTAAAAACCAGCGTGTAGAGGCTGCCTACCGTAAAGAGCTGGTTTATGGTGAAGACGATGCCACGCGCGCGACGCCGCCTACGGTACGCGAGCTGTTTAGCGCCGTACGGAAAAACTATTTCCGCCTCTATTTTCACTATATGTATTTCAACATCGCCCGCATTCTCTATTTGCAGGTCGATAACGTTTTCGGTTTGTTCTTGCTGTTTCCGTCAATTGTTGCCGGTACGATTACGCTCGGCCTGATGACGCAGATTACCAACGTTTTTGGTCAGGTTCGCGGTGCTTTCCAGTACCTGATTAACTCATGGACCACACTGGTTG > NC_000913/397307‑397770 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |