| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,384,808 | C→T | K305K (AAG→AAA) | yfbK ← | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,384,808 | 0 | C | T | 94.7% | 48.8 / ‑6.4 | 19 | K305K (AAG→AAA) | yfbK | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (8/10); total (9/10) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
CAATACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATCATTGAACC > NC_000913/2384565‑2385050 | cAATACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTtcgtcg < 1:108032/251‑1 (MQ=255) agagGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTGTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTcc < 1:198193/251‑1 (MQ=255) cTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTGTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCTCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCctgct < 1:424187/220‑1 (MQ=255) gCCGTTACCAACACCGGCAATTCGCACCATCAGTGCCTCGTTGAAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTACAACAAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTTGATCGTCAAGGCCAACGTTAAAGTCACCTTCAGTGGCTAAAAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACACTTTCGGCGCCTGAGTATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGc < 1:364127/251‑1 (MQ=255) ncAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCg > 1:304731/2‑231 (MQ=255) cATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAAGGCGATTGATGCCGCCCGTAATAAACCCTTtcgtcg < 1:145632/195‑1 (MQ=255) ggCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAACCGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCACCGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTCATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCCTCCAGCg > 1:485274/1‑251 (MQ=255) cccACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTtc > 1:77245/1‑147 (MQ=255) aaCGGCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATGGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACTTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGAGGCCTCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCGGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCTCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCTAATCAAGTGCTGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAgn < 1:94070/251‑2 (MQ=255) cGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTAACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCATCCCgn < 1:146033/167‑2 (MQ=255) aaCACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGACACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGtt > 1:428194/1‑146 (MQ=255) gNNNNNTGANCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCg < 2:304731/143‑1 (MQ=255) tttttGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACTTAAAAGTCACCGTCAGTGGATAATAAAATGCGATGTATGCCTCCTTAAATAAACCCTTTCGTCTCCTCCTAATAACCCAGTGCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTcc < 1:159960/192‑1 (MQ=255) gATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGCTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATcc > 1:337814/1‑246 (MQ=255) gATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGCTGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGACTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGt > 1:330635/1‑251 (MQ=255) cAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCGGTTCCAGCCCGGc > 1:475065/1‑103 (MQ=255) ccAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATcc < 1:168430/228‑1 (MQ=255) cTTAATAAACCCTTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTAAGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTACTTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATAc > 1:331336/1‑140 (MQ=255) taaACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTTCAGCCCGCCACCGCCAATGGCACCGACTTTGACATCCGGCGCATCCATTGCGGCACTAATTTCCGCCTTATGAATCCCGGAGATAGAAGCCAGTGCAATACGGGAGTCGCCAGCGCAGGTCACGATGGCTATGTTATCCTGCTCACGCCGTTCTTTGCCCACTAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAACAGTTCATCAGCACTCATTGAAcc > 1:202445/1‑250 (MQ=255) | CAATACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATCATTGAACC > NC_000913/2384565‑2385050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |