| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,603,321 | C→T | L101L (CTC→CTT) | lsrC → | Autoinducer‑2 ABC transporter membrane subunit LsrC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,603,321 | 0 | C | T | 100.0% | 55.8 / NA | 22 | L101L (CTC→CTT) | lsrC | Autoinducer‑2 ABC transporter membrane subunit LsrC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (8/14); total (8/14) | |||||||||||
ATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTAT > NC_000913/1603084‑1603536 | aTTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGAGTAACGGAATGTGCGCGGTTCTGTTGGGGATGTTACAGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTc < 1:376066/250‑1 (MQ=255) cGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCAACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGtn < 1:316636/250‑2 (MQ=255) cATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGc < 1:107917/246‑1 (MQ=255) cATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCNGATCCTNNTGNCAATGGGCGCGACGCTGGTNATNNNTNNNCNAAATANTGNNGTTTCAGTGNGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGANATTCACTACNNGTTGCTTGTGTCGCGACTTTANTGCNNGNNtngctngcn > 2:107917/1‑192 (MQ=255) gTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTGTGCTTGCGGGATTGTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGc < 1:481434/233‑1 (MQ=255) gatcctgCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGATCTCAGGATATTCACTACCTGTTGCGTGTTTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGTTTGCGGGATTTTTCAACGGTTTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCAGTGTTGCCACCCTTGGCCCGTTAGGGTTGTACAGAGGca < 1:440980/251‑1 (MQ=255) ctgctgGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCCGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTc > 1:475474/1‑171 (MQ=255) cgcgCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTtgcgn < 1:301267/129‑2 (MQ=255) cgcgCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCgg > 2:301267/1‑129 (MQ=255) tatTGNNGTNNNAGNNGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCNGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGNTNTNAACTNNCTGNTGCTTGTGTCNCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGNCNCGTGGCTAAAGATCCCTGcc > 2:368318/1‑166 (MQ=255) tatTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCGTGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGcc < 1:368318/166‑1 (MQ=255) gTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACGGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCGTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGTTTTGCTTGCGGTATTTTTCAACGGTGTCCTg < 1:178080/135‑1 (MQ=255) tgcAGTGGTTTGGATTACCGGAAGGTGGGGGGTGCGGTGGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGGGTCGCGGCTTTACTGCTTGGTTGGCTTGCGGGATTTTTCAACGGGGTCCGGTTGGGGGGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATTTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTg < 1:267298/248‑1 (MQ=255) ttACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTggcgg < 1:144619/205‑1 (MQ=255) tGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCCCCCTTGGCACGTTAGGTTTGTACATAGGCATCATGTTGCTTTGGACTTGCGGCAAATGGATGGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAgn < 1:61904/250‑2 (MQ=255) nggATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCAGAACTGAAACAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAAt > 1:316097/2‑251 (MQ=255) 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aCGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCAAAGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACaga > 1:351566/1‑140 (MQ=255) aCGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTNGCTNGCGGNATNTGTCAACGGTGTCCTNGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACNNTNNNGNTGTACaga < 2:351566/140‑1 (MQ=255) gTTGCTGGGGTCGCGTCTTTGCTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTTTCACCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGTCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCTCCGAACTGAAACAGCGCTCCTCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTAt < 1:229024/251‑1 (MQ=255) ttACTGCTTGGTTTGCTTGCGGGATTTGTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCtgt < 1:182766/118‑1 (MQ=255) tcTTGGTNTGCTTTCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGNNCNNNGNCAttgttg < 2:349029/67‑1 (MQ=255) | ATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAATGTGCGCGGTGCTGTTGGGGATGTTACTGAACGCAGGATATTCACTACCTGTTGCTTGTGTCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTAT > NC_000913/1603084‑1603536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |