| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,337,394 | A→G | S522G (AGC→GGC) | acnA → | aconitate hydratase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,337,394 | 0 | A | G | 100.0% | 56.2 / NA | 19 | S522G (AGC→GGC) | acnA | aconitate hydratase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (11/8); total (11/8) | |||||||||||
GCTGATGGCCGCAGGCTTGCTGGCGAAAAAAGCCGTAACTCTGGGCCTCAAGCGGCAACCATGGGTCAAAGCGTCGCTGGCACCGGGTTCGAAAGTCGTTTCTGATTATCTGGCAAAAGCGAAACTGACACCGTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAAGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTGGTGGTTGCCTATGCGCTGGCGGGAAATATGAATATCAACCTGGCTTCTGAGCCTATCGGCCATGATCGCAAAGGCGATCCGGTTTATCTGAAAGATATCTGG > NC_000913/1337159‑1337594 | gCTGATGGCCGCAGGCTTGCTGGCGAAAAAAGCCGTAACTCTGGGCCTCACGCGGCAACCATGGGTCAAAGCGTCGCTGGCACCGGGTTCGAAAGTCGTTTATGATTATCTGGCAAAAGCGAAACTGACACCGCATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGACACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTcg > 1:369901/1‑251 (MQ=255) cGAAACAAGCCGTAACTCTGGGCCTCAAGCGGCAACCATGGGTCAAAGCGTCGCTGGCACCGGGGTCACAAGTCGTTTCTGATTATCTGGCAAACGCGAAACTGACACCGTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGGATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGACACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGt > 1:345346/1‑251 (MQ=255) gCGGCAACCATGGGTCAAAGCGTCGCTGGCACCGGGTTCGAAAGTCGTTTCTGATTATCTGGCAAAAGCGAAACTGACACCGTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTgg > 1:441268/1‑251 (MQ=255) nnnnnnnnnngntcnnggcgntgCTGGCGCCGGGTTTGAAATTCGNTTCTGATTATCTGGCAAAAGCGAAACAGACANCNTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCNGTATTGGTAANTCTNNGCCGNTNCNCGAGCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGNCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCNNTCNNNCANNCGTaa < 2:369901/201‑1 (MQ=255) naaCCATGGGTCAAAGCGTCGCTGGCACCGGGTTCGAAAGTCGTTTCTGATTATCTGGCAAAAGCGAAACTGACACCGTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTa > 1:132431/2‑250 (MQ=255) gTCAAAGCGTCGCTGGCACCGGGTTCGAAAGTCGTTTCTGATTATCTGGCAACAGCGAAACTGACACCGTCTCTCGACGAACTGGGGGTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTAACAACTGTATTGGTAACTATGGGCCGCAGCCAGATCCTATCGAAACGGCAATCAAACAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGaa > 1:358953/1‑219 (MQ=255) gTTTCTGATTATCTGGCAAAAGCGAAACTGACACCGTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAActggc > 1:15603/1‑220 (MQ=255) gTTTCTGATTATCTGGCAAAAGCGAAACTGACACCGTATCGCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACGCTGGGCCTCTGCCCGATCCGATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTcgg < 1:444247/155‑1 (MQ=255) tGGCAAAAGCGAAACTGACACCGTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTAGCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGTCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTcgc < 1:508313/216‑1 (MQ=255) gacgaACTGGGGTTTAACCTTGTGGGCTACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGTTGCCCGATCCTTTAGAAGCGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAGCCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGAAACCGTAACTTTGAAGGCCGTatccatc > 1:207545/1‑157 (MQ=255) ggggTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGATGCCAGATCCTATCGAAACGGCACTCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCgg > 1:289773/1‑120 (MQ=255) gggTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTcgcc < 1:201931/179‑1 (MQ=255) ggTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTaaacc > 1:24788/1‑158 (MQ=255) gTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCggggcggtgc < 1:137018/90‑1 (MQ=255) tGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTCCCGTCAGGCCACCGTCACTATGAAAGCCGTATACATCCGCTGGTTAAACCTCAATGGCTGGCCCagccgccgc > 1:451210/1‑151 (MQ=255) tGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTGGTGGTTGCCTATGCGCTGGCGGGAAATATGAATATCAACCTGGCTTCTGAGCCTATCGGCCATGATCGCAAAGGCGATCCGGTTTATCTGAAAGATATCTgg < 1:164711/250‑1 (MQ=255) ctctGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTGGTGGTTGcc < 1:424491/151‑1 (MQ=255) gCTGCCCGATCATATCGAAATGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGATGTCAGGCGACAGTAACTTTGAAGGCCGTATACATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCATCGCCGCCGCTGGTGGTTGCCTATGCGCTGGCGGGAAATATGAATATCAAACTGGCTTCTGAGCCTATCGGCCATGATCGCAAAGGCGAACCGGGTTATc > 1:349610/1‑221 (MQ=255) tATCGANNCGGCAATCAAAAAAGGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTaaacc < 2:24788/96‑3 (MQ=255) | GCTGATGGCCGCAGGCTTGCTGGCGAAAAAAGCCGTAACTCTGGGCCTCAAGCGGCAACCATGGGTCAAAGCGTCGCTGGCACCGGGTTCGAAAGTCGTTTCTGATTATCTGGCAAAAGCGAAACTGACACCGTATCTCGACGAACTGGGGTTTAACCTTGTGGGATACGGTTGTACCACCTGTATTGGTAACTCTGGGCCGCTGCCCGATCCTATCGAAACGGCAATCAAAAAAAGCGATTTAACCGTCGGTGCGGTGCTGTCCGGCAACCGTAACTTTGAAGGCCGTATCCATCCGCTGGTTAAAACTAACTGGCTGGCCTCGCCGCCGCTGGTGGTTGCCTATGCGCTGGCGGGAAATATGAATATCAACCTGGCTTCTGAGCCTATCGGCCATGATCGCAAAGGCGATCCGGTTTATCTGAAAGATATCTGG > NC_000913/1337159‑1337594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |