| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 987,152 | G→T | intergenic (‑170/+433) | ompF ← / ← asnS | outer membrane porin F/asparagine‑‑tRNA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 987,152 | 0 | G | T | 100.0% | 36.0 / NA | 14 | intergenic (‑170/+433) | ompF/asnS | outer membrane porin F/asparagine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (7/7); total (7/7) | |||||||||||
GTACCTGCTACTAACAGAGCAGGGACGATCACTGCCAGAATATTGCGCTTCATCATTATTTATTACCCTC‑ATGGTTTTTTTTATGACACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAAGATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAG > NC_000913/986927‑987376 | gTACCTGCTACTAACAGAGCAGGGACGATCACTGCCAGAATATTGCGCTTCATCATTATTTATTACCCTC‑ATGGTTTTTTTTATGACACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAatat > 1:80376/1‑251 (MQ=255) gCTACTAACAGAGCAGGGACGATCACTGCCAGAATATTGCGCTTCATCATTATTTATTACCCTC‑ATGGTTTTTTTTATGACACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCGTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTCTCTCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAAc < 1:85143/250‑1 (MQ=255) aaaaagagAAGGGACGTTCACTGCAAGAATATTTCGTTTCATATTTATTTATGACCCTC‑ATGGTTTTTGTTATTACGCCTGCCACTGCCGGCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGTAACTTTTGATGATAGGTTGTGGTGTTTATGTGTCTGCAGGTATCTTTCCATTCAAACTAAGTTTTCG‑TTCCTTGTAAAGGGTTACAAAGATAAATAGTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAg < 1:67899/247‑1 (MQ=255) ggACGATCACTGCCAGAATATTGCGCTTCATAATTATTTATTACCCTC‑ATTGTTTTTTTTATGACACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCAGTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAAc < 1:34686/234‑1 (MQ=255) atcatTATTTATTACCCTC‑ATGGTTTTTTTTATGACACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCAt > 1:4582/1‑251 (MQ=255) catTATTTATT‑CCCTCTATTGTTTTTTTTAGGACTCCTGGCACTGACGTCAATAAGTTCTGTCAATTAAAATTTACGGAACTATTGATGAAAGTGTGGTGTCTGTATTTGTCTGGAGGCATCGTTCCATTCAAACTAACGTTTCTCTACCATG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTGGGTTTCAAAAATAAAAAATATTTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTGCCATag < 1:26217/251‑1 (MQ=255) ncTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATg > 1:102074/2‑164 (MQ=255) nngTNNNNNCAANAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATg < 2:102074/144‑1 (MQ=255) gTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATCTTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCCAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGAAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAAtt > 1:129371/1‑251 (MQ=255) gagTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGa > 1:141471/1‑250 (MQ=255) cTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTGCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTc < 1:151713/232‑1 (MQ=255) nccATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTGCAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAACGCAAAAATATGTAACCACAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAAAACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAAt > 1:15538/2‑186 (MQ=255) aaCGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTGAATCTATTTATATGAGTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGGTTCTGATGTAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATgn < 1:19352/251‑2 (MQ=255) ngTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAATATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGcc > 1:39802/2‑250 (MQ=255) aacgttagtttgaatggaaagataaatatTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAAGTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATTATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGAGGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAg < 1:156110/234‑1 (MQ=255) | GTACCTGCTACTAACAGAGCAGGGACGATCACTGCCAGAATATTGCGCTTCATCATTATTTATTACCCTC‑ATGGTTTTTTTTATGACACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTG‑AAAGTGCTACAAAGATAAAGATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAG > NC_000913/986927‑987376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |