| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 538,791 | G→A | V387I (GTA→ATA) | ybbW → | putative allantoin transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 538,791 | 0 | G | A | 100.0% | 22.0 / NA | 9 | V387I (GTA→ATA) | ybbW | putative allantoin transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (5/4); total (5/4) | |||||||||||
TGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAATTAATCTTGATGAACTGTATACCGCACCTGGCGATTATAAATATTACGATAACGGTTTTAACCTCACTGCGTTTTCAGTAACTCTGGTGGCCGTTATTTTATCTCTTGGCGGTAAGTTTATTCACTTTATGGAACCGTTATCGCG > NC_000913/538585‑538984 | tgatgaCATCTATCTCCACTAACGCGTCCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGGGCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTAGTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCAGTTATCTTTGCCTCGATATTAGCGGCGGAATGCTTGGTCCGATAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCgg < 1:110834/250‑1 (MQ=255) tCAGATTGCCGCCATTGCACTGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGATAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAATTAATCTTGATGAACTGTATACCGCACCTGGCGATTATAAATATTACg > 1:63951/1‑251 (MQ=255) tGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGATAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAATTAATCTTGATGAACTGTATAc > 1:68745/1‑210 (MQ=255) ataAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGATAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAATTAATCTTGATGAACTGTATACCGCACCTGGCGATTATAAATATTACGATAACGGTTTTAACCTCACTGCGTTTTCAGTAAct < 1:162837/251‑1 (MQ=255) aGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGATTGGTCCGATAATTGGTGTCat > 1:2933/1‑110 (MQ=255) ggAAATTACTGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGATAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAATTAATCTTGATGAACTGTATACCGCACCTGGCGATTATAAATATTACGATAACGGTTTTAACCTCACTGCGTTTTCAGTAACTCTGGTGGCCGTTATTTTATCTCTTGGCGGTAAGTTTATTCACTTTATGGa > 1:140290/1‑250 (MQ=255) gAAATGAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGATAATTgn < 1:19098/75‑2 (MQ=255) aTTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGATAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAATTAATCTTGATGAACTGTATACCGCACCTGGCGATTATAAATATTACGATAACGGTTTTAACCTCACTGCGTTTTCAGTAACTCTGGTGGCCGTTATTTTATCTCTTGGCGGTAAGTTTATTCACTGTATGGAACCGt < 1:21434/251‑1 (MQ=255) gAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGCCGGAATGCTTGGTACGATAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGGGGACAAATTAATCTTGATGACCTGTATTCCGCACCTGGCGATTATAAATATTACGATAACGGTTTTAACCTCACTGCGATATCAGTAACTCTGGTGGCCGTTATTTTATCTCTTGGCGGAAAGTTTATTTAATTTATGTATCCGTTATcgcg > 1:114342/1‑251 (MQ=255) | TGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAATTAATCTTGATGAACTGTATACCGCACCTGGCGATTATAAATATTACGATAACGGTTTTAACCTCACTGCGTTTTCAGTAACTCTGGTGGCCGTTATTTTATCTCTTGGCGGTAAGTTTATTCACTTTATGGAACCGTTATCGCG > NC_000913/538585‑538984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |