| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,268,970 | A→G | T186A (ACA→GCA) | yhaC → | uncharacterized protein YhaC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,268,970 | 0 | A | G | 100.0% | 38.7 / NA | 14 | T186A (ACA→GCA) | yhaC | uncharacterized protein YhaC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (5/9); total (5/9) | |||||||||||
CATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAACAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCG > NC_000913/3268738‑3269117 | naTTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCGAATTTTACTAATGcc > 1:60774/2‑250 (MQ=255) gTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGAGAGCGTTGATCTATCCTCTCTGTACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAAGTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAgg < 1:182733/251‑1 (MQ=255) aaaaaaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCTCAGATAAACATATTGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATGGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGtt < 1:320906/250‑1 (MQ=255) ggTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAATGTAATTTTTAGTTGGGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGGTAATTCTATTTTAAAGCCTTTTAAATTGAATTTAGCAAATTTTACTAATGCTAACATGTTGCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAacac < 1:294415/247‑1 (MQ=255) cccATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGATGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGatt > 1:116400/1‑251 (MQ=255) aTTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCGAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTGGTAAGTGCAACACAAAAc < 1:110555/229‑1 (MQ=255) gTTGTGAGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGCTTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACGATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACAAAAAACGCcac > 1:220100/1‑187 (MQ=255) tGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGGAATTTCGAGTTAGATTATTATGAGATCACAGATAAACATATGGCTAATTCTATTTTAAATCCTTTTAAATTTAATTCAGCAAATTTTACGAAGGCTAACAGGTTTCAGGTTAATTTGGTTAGTTCAAcaca < 1:137102/168‑1 (MQ=255) ggAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAGTTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCANCATNNNNNAg > 2:198168/1‑144 (MQ=255) cGTTGATCTATCCTCTCTGGACTGACGTAATGTCTATTTATATTATTATGATTTCTGAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGtn < 1:39118/132‑2 (MQ=255) gATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAGTTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTcn < 1:198168/250‑2 (MQ=255) ttAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACAGGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTgn < 1:64943/141‑2 (MQ=255) tatGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTACGCAAATTTTACTAATGCAAACATGTTTCAGGTTACTTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATaa > 1:125669/1‑131 (MQ=255) ttCAGCAAATGTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTg < 1:130751/44‑1 (MQ=255) | CATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAACAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCG > NC_000913/3268738‑3269117 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |