| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,747,072 | G→A | L242F (CTT→TTT) | ffh ← | signal recognition particle protein component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,747,072 | 0 | G | A | 100.0% | 24.3 / NA | 10 | L242F (CTT→TTT) | ffh | signal recognition particle protein component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (6/4); total (6/4) | |||||||||||
GGCTAATTTCTCTGCCTGCGCGCGGTCAACTTTGCTTTCGATATCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCGACGCATGGACTTGTTTGATCTCGTCCATCATCGCTTCGTCAACGTGCAGACGACCAGCGGTATCCACCAGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTAACGATATCTACCGGCTTCTG > NC_000913/2746836‑2747300 | ggCTAATTTCTCTGCCAGCGAGCGGTCAACTTTGCTTTCGATATCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCAGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGACAACACCGAGCAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGAACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAACGGTACCGTTTCa > 1:64485/1‑250 (MQ=255) nagaATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAACGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCg > 1:130814/2‑220 (MQ=255) cgacgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGACCTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAACGGTAACGCTTCCTTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAAt > 1:51180/1‑243 (MQ=255) ncTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAACGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCTCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCACCCGGGTTAATCGACGCATGGACTTGTTTGATCTCGTCCatcatc > 1:37958/2‑251 (MQ=255) catttttCTCGCCAACACCGAGGAACGTGATCGGTTTGCCAGTTATGGAACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAACGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTGGCCGTATTGGTCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACATGGTTTCAACCGGGTTAATCGACGCATGGACTTGTTTGATCTCGTCCATCATCGCTTCGTCAACg < 1:154634/248‑1 (MQ=255) aCTTGATCGGTTTGCAAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAACGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCGACGCATGGACTTGTTTGATCTCGTCCATCATCGCTTCGTCAACGTGCAGACGACCAGCGGTAGccacc < 1:171497/251‑1 (MQ=255) aTNNNNNTGCNGGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGTATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAACGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCg < 2:130814/144‑1 (MQ=255) ncgcACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAAAGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCGACGCATGGACTTGTTTGATCTCGTCCATCATCGCTTCGTCAACGTGCAGACGACCAGCGGTATCCCCCAGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAgc > 1:51525/2‑251 (MQ=255) cACCGACGCGGGCATAGCCGTCCAATTTGGTCAACACTACGACGGTAAAAGGTAACGATTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAAACACAAACAGGGATTCAACCGGGTTAATCGACGCATGGACTTGTTTGATCTCGTCCATCATCGCTTCGTCAACGTGCAGACGACCAGCGGTATCCACCAGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGagcc > 1:178551/1‑251 (MQ=255) tGGTCAACACTACGCCGGTAAACTGTAACGCGTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCGACGGATGGACTTGTTTGAGCTCGTCCATCATCGCTTCGTCAACGTGCAGACGACCAGCGGTATCCACCAGCAGCGCGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCGTCTTTCAGCGCCGCGTTAACGATATCTACCGGctgctg < 1:202824/250‑1 (MQ=255) | GGCTAATTTCTCTGCCTGCGCGCGGTCAACTTTGCTTTCGATATCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCGACGCATGGACTTGTTTGATCTCGTCCATCATCGCTTCGTCAACGTGCAGACGACCAGCGGTATCCACCAGCAGCACGTCGTAGAATTTCAGTTTGGCTTCTTTCAGCGCCGCGTTAACGATATCTACCGGCTTCTG > NC_000913/2746836‑2747300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |