| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 616,477 | C→T | P774L (CCG→CTG) | entF → | apo‑serine activating enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 616,477 | 0 | C | T | 100.0% | 23.8 / NA | 10 | P774L (CCG→CTG) | entF | apo‑serine activating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (3/7); total (3/7) | |||||||||||
CAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCCGCCGGGTGTGGCGGGTGATCTCTATCTCACTGGCATTCAACTGGCGCAGGGCTATCTCGGACGCCCCGATCTGACCGCCAGCCGCTTTATTGCCGATCCTTTTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCG > NC_000913/616287‑616684 | cAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTTCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTTGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGc < 1:50410/236‑1 (MQ=255) agagTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTg < 1:7164/251‑1 (MQ=255) gAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGAAGGAAGCGGCGGTCGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGCGGCACTGGCACAGGCGCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTGGTTATTCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCCGCCGGGTGTGGCggggggactctttttctcttgcct > 1:306406/1‑230 (MQ=255) aCCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCCGCCGGGTGTGGCGGGTGATCTCTATCTCACTGGCATTCAACTgg < 1:175595/251‑1 (MQ=255) aCAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCCGCCGGGTGTGGCGGGTGATCTCTATCTCACTGGCATTCAACTGGCGCAGGGCTATCTCGGACGCCCCGAtn < 1:37749/251‑2 (MQ=255) tgtcgctccGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTTCGCGGGAGCAGTGTGCTGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTg < 1:314126/162‑1 (MQ=255) ccGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGAGCGCGGCAGCAGTGTGCTGGTTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCgg > 1:123694/1‑160 (MQ=255) gCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCTTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCCGCCGGGTGGGGCGGGTGATCTCTATCTCACTGGCATTCAACGGGCGCAGGGCTATCTCGGACGCCCCGATCTGACCGCCAGCCGCTTTATGGCCGATCCTTTTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCg < 1:287740/251‑1 (MQ=255) gCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTgc < 1:107246/99‑1 (MQ=255) cGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCTGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTgcc > 1:67764/1‑99 (MQ=255) | CAGAGTTGCGCGACGTTGAAACAGGTTTTCTGTAGTGGTGAGGCCTTACCGGCTGATTTATGCCGCGAATGGCAACAGTTAACTGGCGCGCCGTTGCATAATCTATATGGCCCGACGGAAGCGGCGGTAGATGTCAGCTGGTATCCGGCTTTTGGCGAGGAACTGGCACAGGTGCGCGGCAGCAGTGTGCCGATTGGTTATCCGGTATGGAATACGGGTCTGCGTATTCTTGATGCGATGATGCATCCGGTGCCGCCGGGTGTGGCGGGTGATCTCTATCTCACTGGCATTCAACTGGCGCAGGGCTATCTCGGACGCCCCGATCTGACCGCCAGCCGCTTTATTGCCGATCCTTTTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCG > NC_000913/616287‑616684 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |